| 全国レッドリスト | | 全国レッドリスト 使用申請済。 | (2007/06) |
| 絶滅危惧種 | 絶滅危惧IA類（CR) | ごく近い将来、野生における絶滅の危険性が極めて高い種 |
| | 絶滅危惧ＩB類（EN) | ＩＡ類ほどではないが、近い将来における絶滅の危険性が高い種 |
| | 絶滅危惧Ⅱ類（VU) | 絶滅の危機が増大している植物 |
| 準絶滅危惧種 | 準絶滅危惧（NT) | 現時点では絶滅危険度は小さいが、生育条件の変化によっては「絶滅危惧」に移行する可能性のある種 |
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| 種名 | 科名 | 学名 | 全国カテゴリ |
| アイズヒメアザミ | キク科 | Cirsium aidzuense | EN |
| アオツリバナ | ニシキギ科 | Euonymus yakushimensis | VU |
| アカウキクサ | アカウキクサ科 | Azolla imbricata | VU |
| アカネスゲ | カヤツリグサ科 | Carex poculisquama | VU |
| アカハダクスノキ | クスノキ科 | Beilschmiedia erythrophloia | NT |
| アカヒゲガヤ | イネ科 | Heteropogon contortus | CR |
| アギナシ | オモダカ科 | Sagittaria aginashi | NT |
| アキノハハコグサ | キク科 | Gnaphalium hypoleucum | EN |
| アサザ | ミツガシワ科 | Nymphoides peltata | VU |
| アシボソスゲ | カヤツリグサ科 | Carex scita var. brevisquama | NT |
| アズマホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon takae | VU |
| アズミイヌノヒゲ | ホシクサ科 | Eriocaulon mikawanum ssp. azumianum | EN |
| アゼオトギリ | オトギリソウ科 | Hypericum oliganthum | EN |
| アッケシソウ | アカザ科 | Salicornia europaea | EN |
| アツバタツナミソウ | シソ科 | Scutellaria tsusimensis | NT |
| アテツマンサク | マンサク科 | Hamamelis japonica var. bitchuensis | NT |
| アマミサンショウソウ | イラクサ科 | Elatostema oshimense | CR |
| アラゲサンショウソウ | イラクサ科 | Pellionia brevifolia | VU |
| イシガキキヌラン | ラン科 | Zeuxine flava | NT |
| イシダテクサタチバナ | ガガイモ科 | Cynanchum calcareum | VU |
| イシヅチボウフウ | セリ科 | Angelica saxicola | CR |
| イズノシマホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon zyotanii | NT |
| イズハハコ | キク科 | Conyza japonica | VU |
| イソニガナ | キク科 | Ixeris dentata ssp. nipponica | VU |
| イッスンテンツキ | カヤツリグサ科 | Fimbristylis kadzusana | CR |
| イトイバラモ | イバラモ科 | Najas yezoensis | CR |
| イトキンポウゲ | キンポウゲ科 | Ranunculus reptans | EN |
| イトクズモ | ヒルムシロ科 | Zannichellia palustris var. indica | VU |
| イトテンツキ | カヤツリグサ科 | Bulbostylis densa var. capitata | VU |
| イトトリゲモ | イバラモ科 | Najas japonica | EN |
| イトナルコスゲ | カヤツリグサ科 | Carex laxa | VU |
| イトヒキスゲ | カヤツリグサ科 | Carex remotiuscula | EN |
| イトモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton pusillus | VU |
| イトラッキョウ | ユリ科 | Allium virgunculae | NT |
| イナデンダ | オシダ科 | Polystichum inaense | NT |
| イナトウヒレン | キク科 | Saussurea inaensis | EN |
| イナベアザミ | キク科 | Cirsium magofukui | EN |
| イヌノフグリ | ゴマノハグサ科 | Veronica polita var. lilacina | VU |
| イラブナスビ | ナス科 | Solanum miyakojimense | CR |
| イワキアブラガヤ | カヤツリグサ科 | Scirpus georgianus | CR |
| イワヨモギ | キク科 | Artemisia iwayomogi | VU |
| ウキミクリ | ミクリ科 | Sparganium gramineum | EN |
| ウスギムヨウラン | ラン科 | Lecanorchis kiusiana | NT |
| ウスギモクセイ | モクセイ科 | Osmunthus fragrans var. thunbergii | NT |
| ウスゲチョウジタデ | アカバナ科 | Ludwigia greatrexii | NT |
| ウスバアザミ | キク科 | Cirsium tenue | EN |
| ウスバヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera cerasina | VU |
| ウスユキトウヒレン | キク科 | Saussurea yanagisawae | EN |
| ウバタケニンジン | セリ科 | Angelica ubatakensis | EN |
| ウミジグサ | ヒルムシロ科 | Halodule uninervis | NT |
| ウミヒルモ | トチカガミ科 | Halophila ovalis | NT |
| ウラギク | キク科 | Aster tripolium | VU |
| ウンヌケ | イネ科 | Eulalia speciosa | VU |
| ウンヌケモドキ | イネ科 | Eulalia quadrinervis | VU |
| エキサイゼリ | セリ科 | Apodicarpum ikenoi | EN |
| エゾイトイ | イグサ科 | Juncus potaninii | CR |
| エゾキヌタソウ | アカネ科 | Galium boreale var. kamtschaticum | VU |
| エゾコウゾリナ | キク科 | Hypochaeris crepidioides | VU |
| エゾコウボウ | イネ科 | Hierochloe pluriflora | EN |
| エゾゴゼンタチバナ | ミズキ科 | Cornus suecica | EN |
| エゾサワスゲ | カヤツリグサ科 | Carex oederi | VU |
| エゾタカネニガナ | キク科 | Crepis gymnopus | VU |
| エゾナミキソウ | シソ科 | Scutellaria yezoensis | EN |
| エゾニガクサ | シソ科 | Teucrium veronicoides | CR |
| エゾノクサタチバナ | ガガイモ科 | Cynanchum inamoenum | CR |
| エゾノタカネヤナギ | ヤナギ科 | Salix yezoalpina | EN |
| エゾハリスゲ | カヤツリグサ科 | Carex uda | VU |
| エゾヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera alpigena ssp. glehnii | EN |
| エゾマメヤナギ | ヤナギ科 | Salix nummularia ssp. pauciflora | EN |
| エゾミヤマヤナギ | ヤナギ科 | Salix hidewoi | NT |
| エゾムグラ | アカネ科 | Galium dahuricum var. manshuricum | VU |
| エビアマモ | アマモ科 | Phyllospadix japonicus | NT |
| オオアカウキクサ | アカウキクサ科 | Azolla japonica | VU |
| オオアカバナ | アカバナ科 | Epilobium hirsutum var. villosum | VU |
| オオアブノメ | ゴマノハグサ科 | Gratiola japonica | VU |
| オオイチョウバイカモ | キンポウゲ科 | Ranunculus nipponicus | EN |
| オオイナモリ | アカネ科 | Ophiorrhiza japonica f. acutifolia | NT |
| オオウメガサソウ | イチヤクソウ科 | Chimaphila umbellata | NT |
| オオクグ | カヤツリグサ科 | Carex rugulosa | VU |
| オオシバナ | ホロムイソウ科 | Triglochin maritimum | VU |
| オオチョウジガマズミ | スイカズラ科 | Viburnum carlesii | EN |
| オオツルコウジ | ヤブコウジ科 | Ardisia montana | EN |
| オオニガナ | キク科 | Prenanthes tanakae | VU |
| オオニンジンボク | クマツヅラ科 | Vitex quinata | CR |
| オオヌカキビ | イネ科 | Panicum paludosum | CR |
| オオヒキヨモギ | ゴマノハグサ科 | Siphonostegia laeta | VU |
| オオミズヒキモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton kamogawaensis | EN |
| オオムラホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon omuranum | EN |
| オガサワラススキ | イネ科 | Miscanthus condensatus var. boninensis | NT |
| オガサワラビロウ | ヤシ科 | Livistona boninensis | NT |
| オキナワコウバシ | クスノキ科 | Lindera communis var. okinawensis | CR |
| オキナワソケイ | モクセイ科 | Jasminum superflorum | VU |
| オキナワヒメナキリ | カヤツリグサ科 | Carex sacrosancta var. tamakii | NT |
| オキナワムヨウラン | ラン科 | Lecanorchis triloba | NT |
| オキナワヤブムラサキ | クマツヅラ科 | Callicarpa oshimensis var. okinawensis | EN |
| オグラコウホネ | スイレン科 | Nuphar oguraense | VU |
| オグラノフサモ | アリノトウグサ科 | Myriophyllum oguraense | VU |
| オゼコウホネ | スイレン科 | Nuphar pumilum var. ozeense | VU |
| オゼヌマアザミ | キク科 | Cirsium homolepis | VU |
| オダサムタンポポ | キク科 | Taraxacum platypecidum | NT |
| オニオトコヨモギ | キク科 | Artemisia congesta | VU |
| オニバス | スイレン科 | Euryale ferox | VU |
| オニビトノガリヤス | イネ科 | Calamagrostis onibitoana | EN |
| オニヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera vidalii | VU |
| オノエスゲ | カヤツリグサ科 | Carex tenuiformis | VU |
| オモロカンアオイ | ウマノスズクサ科 | Heterotropa dissita | NT |
| カイジンドウ | シソ科 | Ajuga ciliata var. villosior | EN |
| カガシラ | カヤツリグサ科 | Scleria caricina | EN |
| ガガブタ | ミツガシワ科 | Nymphoides indica | VU |
| ガシャモク | ヒルムシロ科 | Potamogeton dentatus | CR |
| カツラカワアザミ | キク科 | Cirsium lucens var. opacum | VU |
| カドハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis tetraquetra var. tsurumachii | CR |
| カミガモソウ | ゴマノハグサ科 | Gratiola fluviatilis | CR |
| カラフトイワスゲ | カヤツリグサ科 | Carex rupestris | CR |
| カラフトグワイ | オモダカ科 | Sagittaria natans | CR |
| カワゴロモ | カワゴケソウ科 | Hydrobryum japonicum | EN |
| カワヂシャ | ゴマノハグサ科 | Veronica undulata | NT |
| カワツルモ | ヒルムシロ科 | Ruppia maritima | EN |
| カワラニガナ | キク科 | Ixeris tamagawaensis | VU |
| カワリバアマクサシダ | イノモトソウ科 | Pteris cadieri | NT |
| カンエンガヤツリ | カヤツリグサ科 | Cyperus exaltatus var. iwasakii | VU |
| ガンジュアザミ | キク科 | Cirsium ganjuense | VU |
| カンチスゲ | カヤツリグサ科 | Carex gynocrates | CR |
| キクガラクサ | ゴマノハグサ科 | Ellisiophyllum pinnatum var. reptans | VU |
| キシュウナキリスゲ | カヤツリグサ科 | Carex nachiana | EN |
| キセワタ | シソ科 | Leonurus macranthus | VU |
| キタカミヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera demissa var. borealis | CR |
| キタダケオドリコソウ | シソ科 | Lamium album var. kitadakense | NT |
| キタダケカニツリ | イネ科 | Trisetum spicatum var. kitadakense | EN |
| キタダケキンポウゲ | キンポウゲ科 | Ranunculus kitadakeanus | EN |
| キタダケヨモギ | キク科 | Artemisia kitadakensis | VU |
| キタミソウ | ゴマノハグサ科 | Limosella aquatica | CR |
| キノクニスゲ | カヤツリグサ科 | Carex matsumurae | VU |
| キバナハナネコノメ | ユキノシタ科 | Chrysosplenium album var. flavum | NT |
| キビノクロウメモドキ | クロウメモドキ科 | Rhamnus yoshinoi | VU |
| キブネダイオウ | タデ科 | Rumex nepalensis var. andreaeanus | CR |
| キリシマイワヘゴ | オシダ科 | Dryopteris hangchowensis | NT |
| キンキヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera ramosissima var. kinkiensis | EN |
| クグスゲ | カヤツリグサ科 | Carex pseudocyperus | CR |
| クザカイタンポポ | キク科 | Taraxacum kuzakaiense | EN |
| クサナギオゴケ | ガガイモ科 | Cynanchum katoi | VU |
| クサノオウバノギク | キク科 | Youngia chelidoniifolia | VU |
| クジュウツリスゲ | カヤツリグサ科 | Carex kujuzana | VU |
| クシロネナシカズラ | ヒルガオ科 | Cuscuta europaea | CR |
| クスノハカエデ | カエデ科 | Acer oblongum var. itoanum | VU |
| クニガミヒサカキ | ツバキ科 | Eurya zigzag | CR |
| クマガワブドウ | ブドウ科 | Vitis quinqueangularis | CR |
| クマノダケ | セリ科 | Angelica mayebarana | CR |
| クモマキンポウゲ | キンポウゲ科 | Ranunculus pygmaeus | CR |
| クモマスズメノヒエ | イグサ科 | Luzula arcuata ssp. unalascensis | NT |
| クモマタンポポ | キク科 | Taraxacum trigonolobum | EN |
| クリイロスゲ | カヤツリグサ科 | Carex diandra | CR |
| クロイヌノヒゲモドキ | ホシクサ科 | Eriocaulon atroides | VU |
| クロビイタヤ | カエデ科 | Acer miyabei | EN |
| クロホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon parvum | EN |
| グンバイヅル | ゴマノハグサ科 | Veronica onoei | VU |
| ケショウヤナギ | ヤナギ科 | Chosenia arbutifolia | VU |
| ケナシツルモウリンカ | ガガイモ科 | Tylophora tanakae var. glabrescens | NT |
| ケミヤマナミキ | シソ科 | Scutellaria shikokiana var. pubicaulis | EN |
| コイヌガラシ | アブラナ科 | Rorippa cantoniensis | NT |
| コイブキアザミ | キク科 | Cirsium confertissimum | VU |
| コウシュンカズラ | キントラノオ科 | Tristellateia australasiae | NT |
| コキクモ | ゴマノハグサ科 | Limnophila indica subsp. trichophylla | VU |
| コギシギシ | タデ科 | Rumex nipponicus | VU |
| コキツネノボタン | キンポウゲ科 | Ranunculus chinensis | VU |
| コケセンボンギク | キク科 | Lagenophora lanata | CR |
| コケタンポポ | キク科 | Solenogyne mikadoi | VU |
| コケトウバナ | シソ科 | Clinopodium multicaule var. yakusimense | NT |
| コゴメヌカボシ | イグサ科 | Luzula piperi | NT |
| コゴメヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera linderifolia var. konoi | EN |
| コシノカンアオイ | ウマノスズクサ科 | Heterotropa megacalyx | NT |
| コツブヌマハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis parvinux | VU |
| コナミキ | シソ科 | Scutellaria guilielmii | EN |
| コニシハイノキ | ハイノキ科 | Symplocos konishii | NT |
| コバケイスゲ | カヤツリグサ科 | Carex tenuior | VU |
| コバノクロヅル | ニシキギ科 | Tripterygium doianum | VU |
| コバノヒルムシロ | ヒルムシロ科 | Potamogeton cristatus | EN |
| コマイワヤナギ | ヤナギ科 | Salix rupifraga | VU |
| ゴマクサ | ゴマノハグサ科 | Centranthera cochinchinensis var. lutea | EN |
| コモチミミコウモリ | キク科 | Cacalia auriculata var. bulbifera | EN |
| コヤスノキ | トベラ科 | Pittosporum illicioides | NT |
| サイコクヌカボ | タデ科 | Persicaria foliosa var. nikaii | EN |
| サガミトリゲモ | イバラモ科 | Najas indica | EN |
| サキシマエノキ | ニレ科 | Celtis biondii var. insularis | CR |
| サクラバハンノキ | カバノキ科 | Alnus trabeculosa | NT |
| サコスゲ | カヤツリグサ科 | Carex sakonis | NT |
| ササエビモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton nipponicus | EN |
| サツマアザミ | キク科 | Cirsium sieboldii ssp. austrokiushianum | VU |
| サツマハギ | マメ科 | Lespedeza satsumensis | NT |
| サツママンネングサ | ベンケイソウ科 | Sedum satsumense | NT |
| サヤマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex hashimotoi | VU |
| ザラツキヒナガリヤス | イネ科 | Calamagrostis nana ssp. hayachinensis | CR |
| サンショウモ | サンショウモ科 | Salvinia natans | VU |
| シオニラ（ボウバアマモ） | ヒルムシロ科 | Syringodium isoetifolium | NT |
| シコタンキンポウゲ | キンポウゲ科 | Ranunculus grandis var. austrokurilensis | EN |
| シコタンタンポポ | キク科 | Taraxacum shikotanense | EN |
| シチメンソウ | アカザ科 | Suaeda japonica | VU |
| シチョウゲ | アカネ科 | Leptodermis pulchella | NT |
| シデコブシ | モクレン科 | Magnolia tomentosa | VU |
| シナクスモドキ | クスノキ科 | Cryptocarya chinensis | CR |
| シナノアキギリ | シソ科 | Salvia koyamae | EN |
| シナノキシノブ | ウラボシ科 | Microsorium fortunei | NT |
| シナミズニラ | ミズニラ科 | Isoetes sinensis | EN |
| シバタカエデ | カエデ科 | Acer miyabei var. shibatai | EN |
| シバナ | ホロムイソウ科 | Triglochin asiaticum | VU |
| シマイワウチワ | イワウメ科 | Shortia rotundifolia | NT |
| シマギンレイカ | サクラソウ科 | Lysimachia decurrens | NT |
| シマザクラ | アカネ科 | Hedyotis grayi | NT |
| シマササバラン | ラン科 | Liparis formosana var. hachijoensis | NT |
| シマサルスベリ | ミソハギ科 | Lagerstroemia subcostata | VU |
| シマジタムラソウ | シソ科 | Salvia isensis | VU |
| シマタヌキラン | カヤツリグサ科 | Carex doenitzii var. okuboi | NT |
| シマトウヒレン | キク科 | Saussurea insularis | CR |
| シムラニンジン | セリ科 | Pterygopleurum neurophyllum | EN |
| シャクナンガンピ | ジンチョウゲ科 | Daphnimorpha kudoi | NT |
| ショウドシマレンギョウ | モクセイ科 | Forsythia togashii | EN |
| ジョウロウスゲ | カヤツリグサ科 | Carex capricornis | EN |
| シラガブドウ | ブドウ科 | Vitis amurensis var. shiragai | VU |
| シラタマホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon nudicuspe | VU |
| シラヒゲムヨウラン | ラン科 | Lecanorchis flavicans var. acutiloba | NT |
| シラン | ラン科 | Bletilla striata | NT |
| シロウマリンドウ | リンドウ科 | Gentianopsis yabei | NT |
| シロホンモンジスゲ | カヤツリグサ科 | Carex polyschoena | NT |
| シロミノハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis margaritacea | EN |
| シロヤマハギ | マメ科 | Lespedeza kagoshimensis | NT |
| ジングウスゲ | カヤツリグサ科 | Carex sacrosancta | VU |
| スイシャホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon nigrum var. suishaense | NT |
| スキヤクジャク | ミズワラビ科 | Adiantum diaphanum | NT |
| スゲアマモ | アマモ科 | Zostera caespitosa | NT |
| スジヌマハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis equisetiformis | VU |
| スズサイコ | ガガイモ科 | Cynanchum paniculatum | VU |
| スズメハコベ | ゴマノハグサ科 | Microcarpaea minima | EN |
| スブタ | トチカガミ科 | Blyxa echinosperma | VU |
| スルガスゲ | カヤツリグサ科 | Carex omurae | VU |
| スルガヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera alpigena ssp. glehnii var. viridissima | EN |
| セキショウイ | イグサ科 | Juncus prominens | EN |
| センジョウスゲ | カヤツリグサ科 | Carex lehmannii | CR |
| ソハヤキミズ | イラクサ科 | Pilea sohayakiensis | CR |
| タイワンアシカキ | イネ科 | Leersia hexandra | NT |
| タイワンスゲ | カヤツリグサ科 | Carex formosensis | EN |
| タイワンチトセカズラ | マチン科 | Gardneria shimadae | CR |
| タイワントリアシ | イラクサ科 | Boehmeria formosana | VU |
| タイワンフシノキ | ウルシ科 | Rhus javanica | CR |
| タカクマホトトギス | ユリ科 | Tricyrtis ohsumiensis | NT |
| タカサゴソウ | キク科 | Ixeris chinensis ssp. strigosa | VU |
| タカネイ | イグサ科 | Juncus triglumis | NT |
| タカネエゾムギ | イネ科 | Elymus yubaridakensis | CR |
| タカネキンポウゲ | キンポウゲ科 | Ranunculus sulphureus | CR |
| タカネクロスゲ | カヤツリグサ科 | Scirpus maximowiczii | VU |
| タカネコウリンカ | キク科 | Senecio takedanus | NT |
| タカネシバスゲ | カヤツリグサ科 | Carex capillaris | EN |
| タカネスミレ | スミレ科 | Viola crassa | NT |
| タカネタンポポ | キク科 | Taraxacum yuparense | CR |
| タカネナルコ | カヤツリグサ科 | Carex siroumensis | EN |
| タカネハリスゲ | カヤツリグサ科 | Carex pauciflora | VU |
| タカネヒメスゲ | カヤツリグサ科 | Carex melanocarpa | EN |
| タカネママコナ | ゴマノハグサ科 | Melampyrum laxum var. arcuatum | VU |
| タカネヤガミスゲ | カヤツリグサ科 | Carex bipartita | NT |
| ダケスゲ | カヤツリグサ科 | Carex paupercula | VU |
| タコノアシ | ユキノシタ科 | Penthorum chinense | VU |
| タコノキ | タコノキ科 | Pandanus boninensis | NT |
| タジマタムラソウ | シソ科 | Salvia omerocalyx | EN |
| タシロノガリヤス | イネ科 | Calamagrostis tashiroi | EN |
| タシロラン | ラン科 | Epipogium roseum | NT |
| タチイチゴツナギ | イネ科 | Poa nemoralis | EN |
| タチキランソウ | シソ科 | Ajuga makinoi | NT |
| タチゲヒカゲミズ | イラクサ科 | Parietaria micrantha var. coreana | EN |
| タチミゾカクシ | キキョウ科 | Lobelia hancei | CR |
| タチモ | アリノトウグサ科 | Myriophyllum ussuriense | NT |
| タデシナヒメスゲ | カヤツリグサ科 | Carex chinoi | CR |
| タヌキモ | タヌキモ科 | Utricularia australis | VU |
| タマミクリ | ミクリ科 | Sparganium glomeratum | VU |
| タライカヤナギ | ヤナギ科 | Salix taraikensis | VU |
| タルマイスゲ | カヤツリグサ科 | Carex buxbaumii | EN |
| ダンギク | クマツヅラ科 | Caryopteris incana | VU |
| チシマヒメドクサ | トクサ科 | Equisetum variegatum | VU |
| チシマヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera chamissoi | VU |
| チシマミクリ | ミクリ科 | Sparganium hyperboreum | EN |
| チシマミズハコベ | アワゴケ科 | Callitriche hermaphroditica | VU |
| チシマリンドウ | リンドウ科 | Gentianella auriculata | NT |
| チチブシラスゲ | カヤツリグサ科 | Carex planiculmis var. urasawae | CR |
| チチブミネバリ | カバノキ科 | Betula chichibuensis | EN |
| チトセバイカモ | キンポウゲ科 | Ranunculus yesoensis | EN |
| チドリケマン | ケシ科 | Corydalis kushiroensis | NT |
| チャイロスゲ | カヤツリグサ科 | Carex fulvo-rubescens | NT |
| チャボイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis parvula | VU |
| チャンチンモドキ | ウルシ科 | Choerospondias axillaris var. japonica | EN |
| チョウカイアザミ | キク科 | Cirsium chokaiense | VU |
| チョウジガマズミ | スイカズラ科 | Viburnum carlesii var. bitchiuense | NT |
| チョウジソウ | キョウチクトウ科 | Amsonia elliptica | VU |
| チョウセンスイラン | キク科 | Hololeion maximowiczii | EN |
| チョクザキミズ | イラクサ科 | Lecanthus peduncularis | CR |
| ツクシオオガヤツリ | カヤツリグサ科 | Cyperus ohwii | EN |
| ツクシガヤ | イネ科 | Chikusichloa aquatica | VU |
| ツクシクロイヌノヒゲ | ホシクサ科 | Eriocaulon nakasimanum | VU |
| ツクシタンポポ | キク科 | Taraxacum kiushianum | EN |
| ツクシテンツキ | カヤツリグサ科 | Fimbristylis tashiroana | VU |
| ツクシトウキ | セリ科 | Angelica pseudoshikokiana | EN |
| ツクシナルコ | カヤツリグサ科 | Carex subcernua | VU |
| ツクシボウフウ | セリ科 | Pimpinella thellungiana var. gustavohegiana | EN |
| ツクシボダイジュ | シナノキ科 | Tilia rufo-villosa | CR |
| ツシマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex tsushimensis | VU |
| ツシマノダケ | セリ科 | Tilingia tsusimensis | NT |
| ツツイトモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton panormitanus | CR |
| ツメレンゲ | ベンケイソウ科 | Orostachys japonicus | NT |
| ツルカタヒバ | イワヒバ科 | Selaginella biformis | NT |
| ツルギハナウド | セリ科 | Heracleum moellendorfii var. tsurugisanense | VU |
| デンジソウ | デンジソウ科 | Marsilea quadrifolia | VU |
| トガサワラ | マツ科 | Pseudotsuga japonica | VU |
| トカラカンアオイ | ウマノスズクサ科 | Heterotropa yakusimensis var. glabra | NT |
| トキホコリ | イラクサ科 | Elatostema densiflorum | VU |
| トクサラン | ラン科 | Calanthe gracilis var. venusta | NT |
| トクノシマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex kimurae | EN |
| トサトウヒレン | キク科 | Saussurea yoshinagae | EN |
| トサノハマスゲ | カヤツリグサ科 | Cyperus rotundus var. yoshinagae | CR |
| トサボウフウ | セリ科 | Angelica yoshinagae | EN |
| トサムラサキ | クマツヅラ科 | Callicarpa shikokiana | VU |
| トダイアカバナ | アカバナ科 | Epilobium formosanum | VU |
| トダスゲ | カヤツリグサ科 | Carex aequialta | CR |
| トネテンツキ | カヤツリグサ科 | Fimbristylis stauntonii var. tonensis | VU |
| トリゲモ | イバラモ科 | Najas minor | EN |
| ナガエミクリ | ミクリ科 | Sparganium japonicum | NT |
| ナガバアリノトウグサ | アリノトウグサ科 | Haloragis chinensis | CR |
| ナガバコバンモチ | ホルトノキ科 | Elaeocarpus multiflorus | NT |
| ナガバサンショウソウ | イラクサ科 | Pellionia yosiei | EN |
| ナガバハグマ | キク科 | Ainsliaea oblonga | VU |
| ナガバヒゼンマユミ | ニシキギ科 | Euonymus oblongifolius | CR |
| ナガミノツルキケマン | ケシ科 | Corydalis raddeana | NT |
| ナンゴクカモメヅル | ガガイモ科 | Cynanchum austrokiusianum | CR |
| ナンゴクデンジソウ | デンジソウ科 | Marsilea crenata | CR |
| ナンブソモソモ | イネ科 | Poa hayachinensis | EN |
| ナンブトラノオ | タデ科 | Bistorta hayachinensis | CR |
| ニコゲルリミノキ | アカネ科 | Lasianthus bunzanensis | NT |
| ニッケイ | クスノキ科 | Cinnamomun okinawense | NT |
| ニンドウバノヤドリギ | ヤドリギ科 | Scurrula lonicerifolius | NT |
| ヌイオスゲ | カヤツリグサ科 | Carex vanheurckii | VU |
| ヌカボタデ | タデ科 | Persicaria taquetii | VU |
| ヌマアゼスゲ | カヤツリグサ科 | Carex cinerascens | VU |
| ヌマゼリ | セリ科 | Sium suave var. nipponicum | EN |
| ネコヤマヒゴタイ | キク科 | Saussurea modesta | VU |
| ネジリカワツルモ | ヒルムシロ科 | Ruppia rostellata | CR |
| ネムロコウホネ | スイレン科 | Nuphar pumilum | VU |
| ネムロブシダマ | スイカズラ科 | Lonicera chrysantha var. crassipes | VU |
| ネムロホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon glaberrimum | EN |
| ノスゲ | カヤツリグサ科 | Carex tashiroana | VU |
| ノダイオウ | タデ科 | Rumex longifolius | VU |
| ノハラテンツキ | カヤツリグサ科 | Fimbristylis pierotii | VU |
| ノルゲスゲ | カヤツリグサ科 | Carex mackenziei | EN |
| ハイシバ | イネ科 | Lepturus repens | VU |
| ハコネオトギリ | オトギリソウ科 | Hypericum hakonense | NT |
| バシクルモン | キョウチクトウ科 | Trachomitum venetum var. basikururmon | EN |
| ハシナガカンスゲ | カヤツリグサ科 | Carex phaeodon | VU |
| ハナガガシ | ブナ科 | Cyclobalanopsis hondae | EN |
| ハナノキ | カエデ科 | Acer pycnanthum | VU |
| ハナヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera maackii | EN |
| ハナムグラ | アカネ科 | Galium tokyoense | EN |
| ハナヤマツルリンドウ | リンドウ科 | Tripterospermum bistylum | NT |
| ハハコヨモギ | キク科 | Artemisia glomerata | VU |
| ハハジマヌカボシ | ウラボシ科 | Microsorium masaskei | NT |
| ハマジンチョウ | ハマジンチョウ科 | Myoporum bontioides | VU |
| ハマトラノオ | ゴマノハグサ科 | Pseudolysimachion sieboldianum | NT |
| ハマナツメ | クロウメモドキ科 | Paliurus ramosissimus | EN |
| ハリツルマサキ | ニシキギ科 | Maytenus diversifolia | VU |
| ヒイラギソウ | シソ科 | Ajuga incisa | EN |
| ヒキノカサ | キンポウゲ科 | Ranunculus extorris | VU |
| ヒゲナガコメススキ | イネ科 | Ptilagrostis mongholica | EN |
| ヒジハリノキ | アカネ科 | Randia sinensis | CR |
| ヒシモドキ | ゴマ科 | Trapella sinensis | CR |
| ヒゼンコウガイゼキショウ | イグサ科 | Juncus hizenensis | CR |
| ヒゼンマユミ | ニシキギ科 | Euonymus chibai | EN |
| ヒダアザミ | キク科 | Cirsium hidaense | VU |
| ヒダカトウヒレン | キク科 | Saussurea riederi ssp. kudoana | VU |
| ヒダカミネヤナギ | ヤナギ科 | Salix hidakamontana | CR |
| ヒトツバタゴ | モクセイ科 | Chionanthus retusus | VU |
| ヒメウシオスゲ | カヤツリグサ科 | Carex subspathacea | CR |
| ヒメカカラ | ユリ科 | Smilax biflora | NT |
| ヒメキクタビラコ | キク科 | Myriactis japonensis | NT |
| ヒメコウホネ | スイレン科 | Nuphar subintegerrimum | VU |
| ヒメコウモリソウ | キク科 | Cacalia shikokiana | VU |
| ヒメコヌカグサ | イネ科 | Agrostis valvata | NT |
| ヒメシャガ | アヤメ科 | Iris gracilipes | NT |
| ヒメシロアサザ | ミツガシワ科 | Nymphoides coreana | VU |
| ヒメタツナミソウ | シソ科 | Scutellaria kikaiinsularis | CR |
| ヒメタヌキモ | タヌキモ科 | Utricularia minor | VU |
| ヒメドクサ | トクサ科 | Equisetum scirpoides | EN |
| ヒメナエ | マチン科 | Mitrasacme indica | EN |
| ヒメネズミノオ | イネ科 | Sporobolus hancei | CR |
| ヒメバイカモ | キンポウゲ科 | Ranunculus kadzusensis | CR |
| ヒメハッカ | シソ科 | Mentha japonica | VU |
| ヒメバラモミ | マツ科 | Picea maximowiczii | EN |
| ヒメヒゴタイ | キク科 | Saussurea pulchella | VU |
| ヒメビシ | ヒシ科 | Trapa incisa | VU |
| ヒメミクリ | ミクリ科 | Sparganium stenophyllum | VU |
| ヒメミコシガヤ | カヤツリグサ科 | Carex laevissima | EN |
| ヒメミズニラ | ミズニラ科 | Isoetes asiatica | VU |
| ヒメミミカキグサ | タヌキモ科 | Utricularia nipponica | EN |
| ヒメワタスゲ | カヤツリグサ科 | Scirpus hudsonianus | NT |
| ビャッコイ | カヤツリグサ科 | Scirpus crassiusculus | EN |
| ヒュウガトウキ | セリ科 | Angelica furcijuga | VU |
| ヒラモ | トチカガミ科 | Vallisneria higoensis | EN |
| ヒルギダマシ | ヒルギダマシ科 | Avicennia marina | EN |
| ヒルギモドキ | シクンシ科 | Lumnitzera racemosa | CR |
| ビロードムラサキ | クマツヅラ科 | Callicarpa kochiana | VU |
| ヒロハオゼヌマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex traiziscana | NT |
| ヒロハガマズミ | スイカズラ科 | Viburnum koreanum | CR |
| ヒロハタマミズキ | モチノキ科 | Ilex macrocarpa | CR |
| ヒロハマツナ | アカザ科 | Suaeda malacosperma | VU |
| ヒロハヤマヨモギ | キク科 | Artemisia stolonifera | NT |
| ヒンジモ | ウキクサ科 | Lemna trisulca | EN |
| フォーリーアザミ | キク科 | Saussurea fauriei | EN |
| フォーリーガヤ | イネ科 | Schizachne purpurascens | EN |
| フクロダガヤ | イネ科 | Tripogon japonicus | CR |
| フサカンスゲ | カヤツリグサ科 | Carex tokarensis | NT |
| フタマタタンポポ | キク科 | Crepis hokkaidoensis | CR |
| ベニアマモ | ヒルムシロ科 | Cymoodocea rotundata | NT |
| ベニバナヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera maximowiczii var. sachalinensis | VU |
| ホウキガヤツリ | カヤツリグサ科 | Cyperus distans | CR |
| ボウコツルマメ | マメ科 | Glycine clandestina | NT |
| ホウライムラサキ | クマツヅラ科 | Callicarpa formosana | VU |
| ボウラン | ラン科 | Luisia teres | NT |
| ホソバイヌタデ | タデ科 | Persicaria erectominor var. trigonocarpa | EN |
| ホソバウキミクリ | ミクリ科 | Sparganium angustifolium | VU |
| ホソバオグルマ | キク科 | Inula linariifolia | VU |
| ホソバオゼヌマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex nemurensis | VU |
| ホソバクリハラン | ウラボシ科 | Lepisorus boninensis | NT |
| ホソバトウキ | セリ科 | Angelica stenoloba | VU |
| ホソバニガナ | キク科 | Ixeris makinoana | EN |
| ホソバノシバナ | ホロムイソウ科 | Triglochin palustre | VU |
| ホソバハナウド | セリ科 | Heracleum dulce var. akasimontanum | EN |
| ホソバヒルムシロ | ヒルムシロ科 | Potamogeton alpinus | VU |
| ホソバママコナ | ゴマノハグサ科 | Melampyrum setaceum | EN |
| ホソバムカシヨモギ | キク科 | Erigeron acris var. linearifolius | EN |
| ホソバヤマジソ | シソ科 | Mosla chinensis | EN |
| ホソバヤロード | キョウチクトウ科 | Ochrosia hexandra | NT |
| ホロムイクグ | カヤツリグサ科 | Carex oligosperma | VU |
| マシュウヨモギ | キク科 | Artemisia koidzumii var. tsuneoi | VU |
| マツバウミジグサ | ヒルムシロ科 | Halodule pinifolia | NT |
| マツバコケシダ | コケシノブ科 | Crepidomanes latemarginale | NT |
| マネキグサ | シソ科 | Lamium ambiguum | VU |
| マメヒサカキ | ツバキ科 | Eurya emarginata var. minutissima | VU |
| マヤプシギ | ハマザクロ科 | Sonneratia alba | NT |
| マルバアサガオカラクサ | ヒルガオ科 | Evolvulus alsinoides | NT |
| マルバオモダカ | オモダカ科 | Caldesia reniformis | VU |
| マルバテイショウソウ | キク科 | Ainsliaea fragrans var. integrifolia | EN |
| マルバニッケイ | クスノキ科 | Cinnamomum daphnoides | NT |
| マルバノサワトウガラシ | ゴマノハグサ科 | Deinostema adenocaulum | EN |
| マルバハタケムシロ | キキョウ科 | Lobelia loochoensis | EN |
| マルミスブタ | トチカガミ科 | Blyxa aubertii | VU |
| マルヤマシュウカイドウ | シュウカイドウ科 | Begonia laciniata var. formosana | NT |
| マンシュウクロカワスゲ | カヤツリグサ科 | Carex peiktusanii | CR |
| マンシュウボダイジュ | シナノキ科 | Tilia mandschurica | CR |
| ミカワイヌノヒゲ | ホシクサ科 | Eriocaulon mikawanum | CR |
| ミカワシンジュガヤ | カヤツリグサ科 | Scleria mikawana | EN |
| ミカワタヌキモ | タヌキモ科 | Utricularia exoleta | EN |
| ミギワトダシバ | イネ科 | Arundinella riparia | VU |
| ミクリ | ミクリ科 | Sparganium erectum | NT |
| ミクリガヤ | カヤツリグサ科 | Rhynchospora malasica | EN |
| ミシマサイコ | セリ科 | Bupleurum scorzoneraefolium var. stenophyllum | VU |
| ミズアオイ | ミズアオイ科 | Monochoria korsakowii | VU |
| ミズキカシグサ | ミソハギ科 | Rotala leptopetala var. littorea | EN |
| ミズキンバイ | アカバナ科 | Ludwigia stipulacea | CR |
| ミズスギナ | ミソハギ科 | Rotala hippuris | EN |
| ミズタカモジ | イネ科 | Agropyron humidum | VU |
| ミズトラノオ | シソ科 | Eusteralis yatabeana | VU |
| ミズニラ | ミズニラ科 | Isoetes japonica | VU |
| ミズネコノオ | シソ科 | Eusteralis stellata | VU |
| ミズマツバ | ミソハギ科 | Rotala pusilla | VU |
| ミスミイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis fistulosa | EN |
| ミスミソウ s.l. | キンポウゲ科 | Anemone hepatica var. japonica | NT |
| ミゾコウジュ | シソ科 | Salvia plebeia | NT |
| ミヤコミズ | イラクサ科 | Pilea kiotensis | VU |
| ミヤマイ | イグサ科 | Juncus effusus | NT |
| ミヤマカニツリ | イネ科 | Trisetum koidzumianum | EN |
| ミヤマキタアザミ | キク科 | Saussurea franchetii | VU |
| ミヤマコアザミ | キク科 | Cirsium japonicum var. ibukiense | EN |
| ミヤマシロバイ | ハイノキ科 | Symplocos confusa | VU |
| ミヤマハルガヤ | イネ科 | Anthoxanthum odoratum var. furumii | EN |
| ミヤマハンモドキ | クロウメモドキ科 | Rhamnus ishidae | EN |
| ミヤマヤチヤナギ | ヤナギ科 | Salix paludicola | NT |
| ムカゴネコノメ | ユキノシタ科 | Chrysosplenium maximowiczii | NT |
| ムサシモ | イバラモ科 | Najas ancistocarpa | CR |
| ムシャリンドウ | シソ科 | Dracocephalum argunense | EN |
| ムニンエダウチホングウシダ | ホングウシダ科 | Lindsaea repanda | NT |
| ムニンタツナミソウ | シソ科 | Scutellaria longituba | NT |
| ムニンハマウド | セリ科 | Peucedanum boninense | NT |
| ムラサキミミカキグサ | タヌキモ科 | Utricularia uliginosa | VU |
| モクビャクコウ | キク科 | Crossostephium chinense | VU |
| モミジコウモリ | キク科 | Cacalia kiusiana | VU |
| ヤエガワカンバ | カバノキ科 | Betula davurica | VU |
| ヤエヤマコクタン | カキノキ科 | Diospyros ferra var. buxifolia | NT |
| ヤエヤマスズコウジュ | シソ科 | Suzukia luchuensis | VU |
| ヤエヤマネコノチチ | クロウメモドキ科 | Rhamnella franguloides var. inaequilatera | EN |
| ヤエヤマハマゴウ | クマツヅラ科 | Vitex trifolia var. bicolor | NT |
| ヤエヤマハマナツメ | クロウメモドキ科 | Colubrina asiatica | VU |
| ヤエヤマヒメウツギ | ユキノシタ科 | Deutzia yaeyamensis | NT |
| ヤエヤマヤシ | ヤシ科 | Satakentia liukiuensis | NT |
| ヤエヤマラセイタソウ | イラクサ科 | Boehmeria yaeyamensis | NT |
| ヤクシマグミ | グミ科 | Elaeagnus yakusimensis | NT |
| ヤクシマサルスベリ | ミソハギ科 | Lagerstroemia subcostata var. fauriei | NT |
| ヤクシマシソバタツナミ | シソ科 | Scutellaria kiusiana var. kuromidakensis | NT |
| ヤクシマシライトソウ | ユリ科 | Chionographis japonica var. yakusimensis | NT |
| ヤクシマシロバナヘビイチゴ | バラ科 | Fragaria nipponica var. yakusimensis | NT |
| ヤクシマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex atroviridis | VU |
| ヤクシマツルリンドウ | リンドウ科 | Tripterospermum japonicum var. tenue | NT |
| ヤクシマトンボ | ラン科 | Platanthera mandarinorum var. masamunei | NT |
| ヤクシマフウロ | フウロソウ科 | Geranium shikokianum var. yoshiianum | NT |
| ヤクシマミツバツツジ | ツツジ科 | Rhododendron yakumontanum | NT |
| ヤチカンバ | カバノキ科 | Betula ovalifolia | VU |
| ヤチコタヌキモ | タヌキモ科 | Utricularia ochroleuca | EN |
| ヤツガタケキンポウゲ | キンポウゲ科 | Ranunculus yatsugatakensis | EN |
| ヤツガタケトウヒ | マツ科 | Picea koyamae | VU |
| ヤナギタウコギ | キク科 | Bidens cernua | CR |
| ヤナギニガナ | キク科 | Ixeris laevigata var. oldhamii | VU |
| ヤナギヌカボ | タデ科 | Persicaria foliosa var. paludicola | VU |
| ヤナギバモクセイ | モクセイ科 | Osmanthus insularis var. okinawensis | CR |
| ヤブヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera linderifolia | CR |
| ヤブムグラ | アカネ科 | Galium niewerthii | VU |
| ヤブヨモギ | キク科 | Artemisia rubripes | VU |
| ヤブレガサモドキ | キク科 | Syneilesis tagawae | CR |
| ヤマオオウシノケグサ | イネ科 | Festuca rubra var. hondoensis | CR |
| ヤマクボスゲ | カヤツリグサ科 | Carex hymenodon | VU |
| ヤマザトタンポポ | キク科 | Taraxacum arakii | NT |
| ヤマジソ | シソ科 | Mosla japonica | VU |
| ヤマトミクリ | ミクリ科 | Sparganium fallax | VU |
| ヤマトレンギョウ | モクセイ科 | Forsythia japonica | NT |
| ヤマナシウマノミツバ | セリ科 | Sanicula kaiensis | EN |
| ヤマホオズキ | ナス科 | Physalis chamaesarachoides | EN |
| ヤマワキオゴケ | ガガイモ科 | Cynanchum yamanakae | CR |
| ヤリテンツキ | カヤツリグサ科 | Fimbristylis ovata | VU |
| ヤンバルキヌラン | ラン科 | Zeuxine leucochila | NT |
| ヤンバルフモトシダ | コバノイシカグマ科 | Microlepia hookeriana | NT |
| ユウバリカニツリ | イネ科 | Deschampsia caespitosa var. levis | CR |
| ユウレイラン | ラン科 | Didymoplexis subcampanulata | NT |
| ユキバヒゴタイ | キク科 | Saussurea chionophylla | EN |
| ユキヨモギ | キク科 | Artemisia momiyamae | CR |
| ユビソヤナギ | ヤナギ科 | Salix hukaoana | EN |
| ユワンツチトリモチ | ツチトリモチ科 | Balanophora yuwanensis | NT |
| ヨコヤマリンドウ | リンドウ科 | Gentiana glauca | NT |
| リシリカニツリ | イネ科 | Trisetum spicatum | VU |
| リシリトウウチソウ | バラ科 | Sanguisorba stipulata var. rishirensis | NT |
| リシリヒナゲシ | ケシ科 | Papaver fauriei | NT |
| リシリビャクシン | ヒノキ科 | Juniperus sibirica | EN |
| リュウキュウアマモ | ヒルムシロ科 | Cymodocea serrulata | NT |
| リュウキュウクロウメモドキ | クロウメモドキ科 | Rhamnus liukiuensis | NT |
| リュウキュウスガモ | トチカガミ科 | Thalassia hemprichii | NT |
| リュウキュウツワブキ | キク科 | Farfugium japonicum var. luchuense | NT |
| リュウキュウハナイカダ | ミズキ科 | Helwingia liukiuensis | NT |
| リュウノヒゲモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton pectinatus | VU |
| レブンサイコ | セリ科 | Bupleurum triradiatum | CR |
| ロクオンソウ | ガガイモ科 | Cynanchum amplexicaule | EN |
| ワタムキアザミ | キク科 | Cirsium tashiroi | VU |
| ワタヨモギ | キク科 | Artemisia gilvescens | EN |