| 種名 | 科名 | 属名 | 学名 |
| アリアケスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola betonicifolia var. albescens |
| アリサンバライチゴ | バラ科 | キイチゴ属 | Rubus rosifolius var. formosanus |
| アリタソウ | ヒユ科 | アカザ属 | Dysphania ambrosioides |
| アリドオシ | アカネ科 | アリドオシ属 | Damnacanthus indicus |
| アリドオシラン | ラン科 | アリドオシラン属 | Myrmechis japonica |
| アリノトウグサ | アリノトウグサ科 | アリノトウグサ属 | Haloragis micrantha |
| アリマウマノスズクサ | ウマノスズクサ科 | ウマノスズクサ属 | Aristolochia onoei |
| アレチイヌノフグリ | オオバコ科 | クワガタソウ属 | Veronica opaca |
| アレチウリ | ウリ科 | アレチウリ属 | Sicyos angulatus |
| アレチギシギシ | タデ科 | ギシギシ属 | Rumex conglomeratus |
| アレチヌスビトハギ | マメ科 | ヌスビトハギ属 | Desmodium paniculatum |
| アレチノギク | キク科 | イズハハコ属 | Conyza bonariensis |
| アレチハナガサ | クマツヅラ科 | クマツヅラ属 | Verbena brasiliensis |
| アレチマツヨイグサ | アカバナ科 | マツヨイグサ属 | Oenothera biennis |
| アワガタケスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola awagatakensis |
| アワコガネギク | キク科 | キク属 | Chrysanthemum boreale |
| アワダン | ミカン科 | アワダン属 | Melicope triphylla |
| アワノミツバツツジ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron dilatatum var. lasiocarpum |
| アワノモチツツジ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron macrosepalum var. decandrum |
| アワブキ | アワブキ科 | アワブキ属 | Meliosma myrianth |
| アワモリショウマ | ユキノシタ科 | チダケサシ属 | Astilbe japonica |
| アンドンマユミ | ニシキギ科 | ニシキギ属 | Euonymus oligospermus |
| イイギリ | イイギリ科 | イイギリ属 | Idesia polycarpa |
| イオウトウキイチゴ | バラ科 | キイチゴ属 | Rubus boninensis |
| イオウノボタン | ノボタン科 | ノボタン属 | Melastoma candidum var. alessandrense |
| イガアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium nipponicum var. comosum |
| イガオナモミ | キク科 | オナモミ属 | Xanthium italicum |
| イガガヤツリ | カヤツリグサ科 | カヤツリグサ属 | Cyperus polystachyos |
| イガホオズキ | ナス科 | イガホオズキ属 | Physaliastrum japonicum (Fr. et Sav.) Honda. |
| イカリソウ | メギ科 | イカリソウ属 | Epimedium grandiflorum var. thunbergianum |
| イグサ | イグサ科 | イグサ属 | Juncus effusus var. decipiens |
| イケマ | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Cynanchum caudatum |
| イシガキスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola tashiroi var. tairae |
| イシカグマ | コバノイシカグマ科 | フモトシダ属 | Microlepia strigosa |
| イシダテホタルブクロ | キキョウ科 | ホタルブクロ属 | Campanula punctata var. kurokawae |
| イシヅチテンナンショウ | サトイモ科 | テンナンショウ属 | Arisaema ishizuchiense |
| イシミカワ | タデ科 | イヌタデ属 | Persicaria perfoliata |
| イシモチソウ | モウセンゴケ科 | モウセンゴケ属 | Drosera pelata var. nipponica |
| イズカモメヅル | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Vincetoxicum izuense |
| イズクリハラン | ウラボシ科 | クリハラン属 | Neocheiropteris ensata var. izuensis |
| イズコモチシダ | シシガシラ科 | コモチシダ属 | Woodwardia x izuensis |
| イズセンリョウ | ヤブコウジ科 | イズセンリョウ属 | Maesa japonica |
| イズドコロ | ヤマノイモ科 | ヤマノイモ科 | Dioscorea izuensis |
| イスノキ | マンサク科 | イスノキ属 | Distylium racemosum |
| イズノシマウメバチソウ | ユキノシタ科 | ウメバチソウ属 | Parnassia palustris var. izuinsularis |
| イズノシマダイモンジソウ | ユキノシタ科 | ユキノシタ属 | Saxifraga fortunei var. crassifolia |
| イズハハコ | キク科 | イズハハコ属 | Conyza japonica |
| イスミスズカケ | ゴマノハグサ科 | クガイソウ属 | Veronicastrum nogutii |
| イズヤブソテツ | オシダ科 | ヤブソテツ属 | Cyrtomium atropunctatum |
| イズヨシノ | バラ科 | サクラ属 | Cerasus × yedoensis |
| イセウキヤガラ | カヤツリグサ科 | ウキヤガラ属 | Bolboschoenus planiculmis |
| イセノカンアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Heterotropa savatieri subsp. pseudosavatieri var. iseanum |
| イセハナビ | キツネノマゴ科 | イセハナビ属 | Strobilanthes japonicus |
| イソギク | キク科 | キク属 | Dendranthema pacificum |
| イソスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola grayi Franch. et Savat. |
| イソツツジ | ツツジ科 | イソツツジ属 | Ledum palustre var. diversipilosum |
| イソノギク | キク科 | シオン属 | Aster asa-grayi |
| イソフジ | マメ科 | クララ属 | Sophora tomentosa |
| イソマツ | イソマツ科 | イソマツ属 | Limonium wrightii |
| イソヤマテンツキ | カヤツリグサ科 | テンツキ属 | Fimbristylis ferruginea |
| イタチガヤ | イネ科 | イタチガヤ属 | Pogonatherum crinitum |
| イタチササゲ | マメ科 | レンリソウ属 | Lathyrus davidii |
| イタチハギ | マメ科 | イタチハギ属 | Amorpha fruticosa Linn |
| イタドリ | ゴマノハグサ科 | イタドリ属 | Reynoutria japonica |
| イタビカズラ | クワ科 | イチジク属 | Ficus nipponica |
| イタヤカエデ | カエデ科 | カエデ属 | Acer mono var. marmoratum f. dissectum |
| イタリーマンテマ | ナデシコ科 | マンテマ属 | Silene giraldii Guss |
| イチイ | イチイ科 | イチイ属 | Taxus cuspidata |
| イチゴノキ | ツツジ科 | イチゴノキ属 | Arbutus uned |
| イチハツ | アヤメ科 | アヤメ属 | Iris tectorum |
| イチビ | アオイ科 | イチビ属 | Abutilon theophrasti Medic |
| イチヤクソウ | イチヤクソウ科 | イチヤクソウ属 | Pyrola japnica |
| イチョウ | イチョウ科 | イチョウ属 | Ginkgo biloba |
| イチヨウラン | ラン科 | イチヨウラン属 | Dactylostalix ringens |
| イチリンソウ | キンポウゲ科 | イチリンソウ属 | Anemone nikoensis |
| イッポンワラビ | イワデンダ科 | シケチシダ属 | Cornopteris crenulatoserrulata |
| イトイヌノハナヒゲ | カヤツリグサ科 | ミカヅキグサ属 | Rhynchospora faberi |
| イトイヌノヒゲ | ホシクサ科 | ホシクサ属 | Eriocaulon dscemfloum Maxim. |
| イトキンポウゲ | キンポウゲ科 | キンポウゲ属 | Ranunculus reptans |
| イトシャジン | キキョウ科 | ホタルブクロ属 | Campanula rotundifolia |
| イトススキ | イネ科 | ススキ属 | Miscanthus sinensis f. gracillimus |
| イトトリゲモ | トチカガミ科 | イバラモ属 | Najas gracillima |
| イトヒメハギ | ヒメハギ科 | ヒメハギ属 | Polygala tenuifolia |
| イトラッキョウ | ユリ科 | ネギ属 | Allium virgunculae |
| イナトウヒレン | キク科 | トウヒレン属 | Saussurea inaensis |
| イナヒロハテンナンショウ | サトイモ科 | テンナンショウ属 | Arisaema amurense var. inaense |
| イナモリソウ | アカネ科 | イナモリソウ属 | Pseudopyxis depressa Miq. |
| イヌアワ | イネ科 | エノコログサ属 | Setaria chondrachne |
| イヌイワイタチシダ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris saxifragivaria |
| イヌイワガネソウ | イノモトソウ科 | イワガネゼンマイ属 | Coniogramme x fauriei |
| イヌウメモドキ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex serrata Thunb. |
| イヌカキネガラシ | アブラナ科 | カキネガラシ属 | Sisymbrium orientalis |
| イヌカタヒバ | イワヒバ科 | イワヒバ属 | Selaginella moellendorffii |
| イヌガヤ | イチイ科 | イヌガヤ属 | Cephalotaxus harringtonia |
| イヌガラシ | アブラナ科 | イヌガラシ属 | Rorippa indica |
| イヌガンソク | イワデンダ科 | コウヤワラビ属 | Onoclea orientalis |
| イヌキクイモ | キク科 | キクイモ属 | Helianthus strumosus |
| イヌコウジュ | シソ科 | イヌコウジュ属 | Mosla punctulata |
| イヌコハコベ | ナデシコ科 | ハコベ属 | Stellaria pallida |
| イヌゴマ | シソ科 | イヌゴマ属 | Stachys japonica var. intermedia |
| イヌコモチナデシコ | ナデシコ科 | イヌコモチナデシコ属 | Petrorhagia dubia |
| イヌコリヤナギ | ヤナギ科 | ヤナギ属 | Salix integra Thunb. |
| イヌザクラ | バラ科 | サクラ属 | Prunus buergeriana |
| イヌザンショウ | ミカン科 | イヌザンショウ属 | Fagara mantchurica |
| イヌシデ | カバノキ科 | クマシデ属 | Carpinus tschonoskii |
| イヌショウマ | キンポウゲ科 | サラシナショウマ属 | Cimicifuga japonica |
| イヌセンブリ | リンドウ科 | センブリ属 | Swertia diluta var. tosaensis |
| イヌタデ | タデ科 | イヌタデ属 | Persicaria longiseta |
| イヌタヌキモ | タヌキモ科 | タヌキモ属 | Utricularia australis |
| イヌタマシダ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris hayatae |
| イヌツゲ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex crenata Thunb. |
| イヌツルタカナワラビ | オシダ科 | カナワラビ属 | Arachniodes x pseudo-repens |
| イヌトウバナ | シソ科 | トウバナ属 | Clinopodium micranthum |
| イヌドクサ | トクサ科 | トクサ属 | Equisetum ramosissimum |
| イヌナズナ | アブラナ科 | イヌナズナ属 | Draba nemorosa |
| イヌヌマトラノオ | サクラソウ科 | オカトラノオ属 | Lysimachia pilophora |
| イヌノフグリ | ゴマノハグサ科 | クワガタソウ属 | Veronica didyma var. lilac |
| イヌハギ | マメ科 | ハギ属 | Lespedeza tomentosa |
| イヌハコネトリカブト | キンポウゲ科 | トリカブト属 | Aconitum x parahakonense |
| イヌビエ | イネ科 | イヌビエ属 | Echinochloa crus-galli var. caudata |
| イヌヒメコズチ | シソ科 | イヌコウジュ属 | Salvia reflexa Hornem |
| イヌビユ | ヒユ科 | ヒユ属 | Amaranthus lividus L. |
| イヌビワ | クワ科 | イチジク属 | Ficus erecta |
| イヌブナ | ブナ科 | ブナ属 | Fagus japonica |
| イヌホオズキ | ナス科 | ナス属 | Solanum nigrum |
| イヌホシダ | ヒメシダ科 | ヒメシダ属 | Thelypteris acuminata var. kuliangensis |
| イヌホタルイ | カヤツリグサ科 | ホソガタホタルイ属 | Schoenoplectus juncoides |
| イヌマキ | マキ科 | マキ属 | Podocarpus macrophyllus |
| イヌムギ | イネ科 | スズメノチャヒキ属 | Bromus catharticus |
| イヌムラサキ | ムラサキ科 | イヌムラサキ属 | Lithospermum arvense |
| イヌヤマハッカ | シソ科 | ヤマハッカ属 | Isodon umbrosus |
| イヌヤマモモソウ | アカバナ科 | ガウラ属 | Gaura parviflora |
| イヌヨモギ | キク科 | ヨモギ属 | Artemisia keiskeana |
| イヌワラビ | イワデンダ科 | メシダ属 | Athyrium niponicum |
| イノデ | オシダ科 | イノデ属 | Polystichum polyblepharum |
| イノデモドキ | オシダ科 | イノデ属 | Polystichum tagawanum |
| イノモトソウ | イノモトソウ科 | イノモトソウ属 | Pteris multifida |
| イブキシモツケ | バラ科 | シモツケ属 | Japanese Spirea |
| イブキジャコウソウ | シソ科 | イブキジャコウソウ属 | Thymus serpyllum ssp. quinquecostatus |
| イブキスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola mirabilis var. subglabra |
| イブキゼリモドキ | セリ科 | シラネニンジン属 | Tilingia holopetala |
| イブキトラノオ | タデ科 | イブキトラノオ属 | Polygonum bistorta |
| イブキフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium yesoense var. lobato-dentatum |
| イブキボウフウ | セリ科 | イブキボウフウ属 | Libanotis coreana |
| イボクサ | ツユクサ科 | イボクサ属 | Murdannia keisak |
| イボタノキ | モクセイ科 | イボタノキ属 | Ligustrum obtusifolium |
| イボタヒョウタンボク | スイカズラ科 | スイカズラ属 | Lonicera demissa Rehder var. demissa |
| イモカタバミ | カタバミ科 | カタバミ属 | Oxalis articulata |
| イモネノホシアサガオ | ヒルガオ科 | サツマイモ属 | Ipomoea trichocarpa |
| イヨカズラ | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Vincetoxicum japonicum C.Morren et Decne. |
| イヨクジャク | イワデンダ科 | Diplazium属 | Diplazium okudairae |
| イヨフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium shikokianum |
| イラクサ | イラクサ科 | イラクサ属 | Urtica thunbergiana |
| イラブナスビ | ナス科 | ナス属 | Solanum miyakojimense |
| イリオモテクマタケラン | ショウガ科 | ハナミョウガ属 | Alpinia flabellata |
| イリオモテシャミセンヅル | フサシダ科 | カニクサ属 | Lygodium microphyllum |
| イリオモテニシキソウ | トウダイグサ科 | ニシキソウ属 | Chamaesyce thymifolia |
| イロハモミジ | カエデ科 | カエデ属. | Acer palmatum |
| イワアカバナ | アカバナ科 | アカバナ属 | Epilobium cephalostigma |
| イワイチョウ | ミツガシワ科 | イワイチョウ属 | Nephrophyllidium crista-galli |
| イワインチン | キク科 | キク属 | Chrysanthemum rupestre |
| イワウサギシダ | イワデンダ科 | ウサギシダ属 | Gymnocarpium jessoense |
| イワウチワ | イワウメ科 | イワウチワ属 | Shortia uniflora |
| イワウラジロ | イノモトソウ科 | エビガラシダ属 | Cheilanthes krameri |
| イワオウギ | マメ科 | イワオウギ属 | Hedysarum vicioides subsp. japonicum var. japonicum |
| イワオトギリ | オトギリソウ科 | オトギリソウ属 | Hypericum erectum var. hondoense |
| イワオモダカ | ウラボシ科 | ヒトツバ属 | Pyrrosia hastata |
| イワカガミ | イワウメ科 | イワカガミ属 | Schizocodon soldanelloides |
| イワガネゼンマイ | ホウライシダ科 | イワガネゼンマイ属 | Coniogramme intermedia |
| イワガネソウ | ホウライシダ科 | イワガネゼンマイ属 | Coniogramme japonica |
| イワカラクサ | ゴマノハグサ科 | エリヌス属 | Erinus alpinus |
| イワガラミ | ユキノシタ科 | イワガラミ属 | Schizophragma hydrangeoides |
| イワギク | キク科 | キク属 | Dendranthema zawadskii |
| イワキハグマ | キク科 | コウヤボウキ属 | Pertya x suzukii |
| イワギボウシ | ユリ科 | ギボウシ属 | Ｈosta longipes |
| イワギリソウ | イワタバコ科 | イワギリソウ属 | Opithandra primuloides |
| イワキンバイ | バラ科 | キジムシロ属 | Potentilla dickinsii |
| イワザクラ | サクラソウ科 | サクラソウ属 | Primula tosaensis Yatabe |
| イワザンショウ | ミカン科 | サンショウ属 | Zanthoxylum beecheyanum |
| イワシモツケ | バラ科 | シモツケ属 | Spiraea nipponica |
| イワシャジン | キキョウ科 | ツリガネニンジン属 | Adenophora takedae |
| イワショウブ | ユリ科 | チシマゼキショウ属 | Tofieldia japonica |
| イワセントウソウ | セリ科 | イワセントウソウ属 | Pternopetalum tanakae |
| イワタイゲキ | トウダイグサ科 | トウダイグサ属 | Euphorbia jolkinii Boiss. |
| イワタカンアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum kurosawae |
| イワタバコ | イワタバコ科 | イワタバコ属 | Conandron ramondioides |
| イワダレソウ | クマツヅラ科 | イワダレソウ属 | Lippia nodiflora |
| イワチドリ | ラン科 | ヒナラン属 | Amitostigma keiskei. |
| イワツツジ | ツツジ科 | スノキ属 | Vaccinium praestans |
| イワツメクサ | ナデシコ科 | ハコベ属 | Stellaria nipponica |
| イワデンダ | イワデンダ科 | イワデンダ属 | Woodsia polystichoides |
| イワナシ | ツツジ科 | イワナシ属 | Epigaea asiatica |
| イワナンテン | ツツジ科 | イワナンテン属 | Leucothoe keiskei Miq. |
| イワニンジン | セリ科 | シシウド属 | Angelica hakonensis |
| イワネコノメソウ | ユキノシタ科 | ネコノメソウ属 | Chrysosplenium echinus |
| イワハタザオ | アブラナ科 | ヤマハタザオ属 | Arabis serrata var. japonica |
| イワヒゲ | ツツジ科 | イワヒゲ属 | Cassiope lycopodioides |
| イワヒトデ | ウラボシ科 | イワヒトデ属 | Colysis elliptica |
| イワヒバ | イワヒバ科 | イワヒバ属 | Selaginella tamariscina |
| イワヒメワラビ | コバノイシカグマ科 | イワヒメワラビ属 | Hypolepis punctata |
| イワブクロ | ゴマノハグサ科 | イワブクロ属 | Pennellianthus frutescens |
| イワヘゴ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris atrata |
| イワヘゴモドキ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris x mayebarae, Dryopteridaceae |
| イワベンケイ | ベンケイソウ科 | イワベンケイ属 | Rhodiola rosea |
| イワホウライシダ | ホウライシダ科 | ホウライシダ属 | Adiantum ogasawarense |
| イワボタン | ユキノシタ科 | ネコノメソウ属 | Chrysosplenium macrostemon |
| イワヤツデ | ユキノシタ科 | イワヤツデ属 | Mukdenia rossii |
| イワユキノシタ | ユキノシタ科 | イワユキノシタ属 | Tanakaea radicicans |
| イワヨモギ | キク科 | ヨモギ属 | Artemisia iwayomogi |
| インドヒモカズラ | ヒユ科 | インドヒモカズラ属 | Deeringia polysperma |
| ウイキョウ | セリ科 | ウイキョウ属 | Foeniculum vulgare |
| ウオトリギ | シナノキ科 | ウオトリギ属 | Grewia biloba |
| ウキヤガラ | カヤツリグサ科 | ホタルイ属 | Scirpus yagara Ohwi |
| ウグイスカグラ | スイカズラ科 | スイカズラ属 | Lonicera gracilipes var. glandulosa |
| ウゴアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium ugoense |
| ウゴツクバネウツギ | スイカズラ科 | ツクバネウツギ属 | Abelia spathulata var. stenophylla |
| ウコン | ショウガ科 | ウコン属 | Curcuma longa L |
| ウコンイソマツ | イソマツ科 | イソマツ属 | Limonium wrightii |
| ウサギアオイ | アオイ科 | ゼニアオイ属 | Malva parviflora L. |
| ウサギギク | キク科 | ウサギギク属 | Arnica unalascensis var. tschonoskyi |
| ウサギゴケ | タヌキモ科 | タヌキモ属 | Utricularia sandersonii |
| ウサギノオ | イネ科 | ウサギノオ属 | Lagurus ovatus |
| ウシオハナツメクサ | ナデシコ科 | ウシオツメクサ属 | Spergularia bocconii |
| ウシタキソウ | アカバナ科 | ミズタマソウ属 | Circaea cordata Royle |
| ウシノシッペイ | イネ科 | ウシノシッペイ属 | Hemarthria sibirica |
| ウシハコベ | ナデシコ科 | ハコベ属 | Myosoten aquaticum |
| ウシミツバ | セリ科 | ミツバ属 | Cryptotaenia canadensis subsp. japonica f. dissecta |
| ウスアカカタバミ | カタバミ科 | カタバミ属 | Oxalis corniculata f. tropaeolides |
| ウスイロツユクサ | ツユクサ科 | ツユクサ属 | Commelina communis f. caerulepurpurascens |
| ウスイロツリフネソウ | ツリフネソウ科 | ツリフネソウ属 | Impatiens textori |
| ウスギオウレン | キンポウゲ科 | オウレン属 | Coptis lutescens |
| ウスギハマカンゾウ | ユリ科 | ワスレグサ属 | Hemerocallis x fallaxlittoralis |
| ウスギモクセイ | モクセイ科 | モクセイ属 | Osmanthus fragrans var. thunbergii |
| ウスギヨウラク | ツツジ科 | ヨウラクツツジ属 | Menziesia cilicalix |
| ウスギワニグチソウ | ユリ科 | ナルコユリ属 | Polygonatum cryptanthum |
| ウスゲサイシン | ウマノスズクサ科 | フタバアオイ属 | Asarum heterotropoides var. seoulense |
| ウスゲタマブキ | キク科 | コウモリソウ属 | Cacalia farfaraefolia. |
| ウスゲチョウジタデ | アカバナ科 | チョウジタデ属 | Ludwigia epilobioides |
| ウスゲヤマザクラ | バラ科 | サクラ属 | Cerasus jamasakura f. pubescens |
| ウスノキ | ツツジ科 | スノキ属 | Vaccinium hirtum |
| ウスバオニヤブソテツ | オシダ科 | ヤブソテツ属 | Cyrtomium falcatum subsp. australe x C. falcatum subsp. falcatum |
| ウスバサイシン | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum sieboldii |
| ウスバシダ | ナナバケシダ科 | ナナバケシダ属 | Tectaria devexa |
| ウスバヒメツバキ | ツバキ科 | カメリア属 | Camellia euryoides var. nokoensis |
| ウスバヤブマメ | マメ科 | ヤブマメ属 | Amphicarpaea edgeworthii var. japonica var. trisperma |
| ウスバラセイタソウ | イラクサ科 | カラムシ属 | Boehmeria tenuifolia |
| ウスベニアオイ | アオイ科 | ゼニアオイ属 | Malva sylvestris |
| ウスベニアカショウマ | ユキノシタ科 | チダチサシ属 | Astilbe thunbergii var. thunbergii f. rosea |
| ウスベニシモバシラ | ウコギ科 | タラノキ属 | Aralia cordata |
| ウスベニチチコグサ | キク科 | チチコグサモドキ属 | Gamochaeta purpurea |