| 種名 | 科名 | 属名 | 学名 |
| オオナンバンギセル | ハマウツボ科 | ナンバンギセル属 | Aeginetia sinensis |
| オオニガナ | キク科 | フクオウソウ属 | Prenanthes tanakae |
| オオニシキソウ | トウダイグサ科 | トウダイグサ属 | Euphorbia maculata |
| オオニワゼキショウ | アヤメ科 | ニワゼキショウ属 | Sisyrinchium graminoides |
| オオヌマハリイ | カヤツリグサ科 | ハリイ属 | Eleocharis mamillata Lindb. fil. var. cyclocarpa Kitag |
| オオバアサガラ | エゴノキ科 | アサガラ属 | Pterostyrax hispida Sieb. et Zucc. |
| オオバイヌツゲ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex crenata f. latifolia |
| オオバイヌビワ | クワ科 | イチジク属 | Ficus septics |
| オオバイボタ | モクセイ科 | イボタノキ属 | Ligustrum ovalifolium |
| オオバウマノスズクサ | ウマノスズクサ科 | ウマノスズクサ属 | Aristlochia kaempferi Willd |
| オオバオオヤマレンゲ | モクレン科 | モクレン属 | Magnolia sieboldii subsp. Sieboldii |
| オオバカンアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Heterotropa lutchuensis (T. Ito) Honda |
| オオバキスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola brevistipulata (Franch. et Sav.) W.Becker subsp. Brevistipulata |
| オオバギボウシ | ユリ科 | ギボウシ属 | Hosta montana |
| オオバクサフジ | マメ科 | ソラマメ属 | Vicia pseudo-orobus |
| オオバクロモジ | クスノキ科 | クロモジ属 | Lindera umbellata |
| オオバコ | オオバコ科 | オオバコ属 | Plantago asiatica |
| オオバコウモリ | キク科 | コウモリソウ属 | Cacalia hastata subsp. orientalis var. ramosa |
| オオバコケモモ | ツツジ科 | スノキ属 | Vaccinium emarginatum |
| オオバコチチコグサ | キク科 | エゾノチチコグサ属 | Antennaria plantagifolia |
| オオハシバミ | カバノキ科 | ハシバミ属 | Corylus heterophylla |
| オオバシマムラサキ | クマツヅラ科 | ムラサキシキブ属 | Callicarpa subpubescens |
| オオバジャノヒゲ | ユリ科 | ジャノヒゲ属 | Ophiopogon planiscapus |
| オオバショウマ | キンポウゲ科 | サラシナショウマ属 | Cimicifuga acerina |
| オオバショリマ | ヒメシダ科 | ヒメシダ属 | Thelypteris quelpaertensis var. quelpaertensis |
| オオバシロテツ | ミカン科 | シロテツ属 | Boninia grisea |
| オオバスノキ | ツツジ科 | スノキ属 | Vaccinium smallii var. smallii |
| オオバタケシマラン | ユリ科 | タケシマラン属 | Streptopus amplexifolius var. papillatus |
| オオバタネツケバナ | アブラナ科 | タネツケバナ属 | Cardamine scutata |
| オオバチドメ | ウコギ科 | チドメグサ属 | Hydrocotyle javanica |
| オオバツツジ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron nipponicum |
| オオバナイトタヌキモ | タヌキモ科 | タヌキモ属 | Utricularia gibba |
| オオバナウツボグサ | シソ科 | ウツボグサ属 | Prunella grandiflora |
| オオハナウド | セリ科 | ハナウド属 | Heracleum lanatum |
| オオバナノエンレイソウ | ユリ科 | エンレイソウ属 | Trillium kamtschatic |
| オオバナノセンダングサ | キク科 | センダングサ属 | Bidens pilosa var. radiata |
| オオハナワラビ | ハナヤスリ科 | ハナワラビ属 | Sceptridium japonicum |
| オオバネムノキ | マメ科 | ネムノキ属 | Albizia kalkora |
| オオバノアマクサシダ | イノモトソウ科 | イノモトソウ属 | Pteris excelsa var. simplicior |
| オオバノイノモトソウ | イノモトソウ科 | イノモトソウ属 | Pteris cretica L. |
| オオバノキハダ | ミカン科 | キハダ属 | Phellodendron amurense var. japonicum |
| オオバノトンボソウ | ラン科 | ツレサギソウ属 | Platanthera minor |
| オオバノヨツバムグラ | アカネ科 | ヤエムグラ属 | Galium kamtschaticum var. acutifolium |
| オオハマオモト | ヒガンバナ科 | ハマオモト属 |
Crinum asiaticum var. sinicum |
| オオハマギキョウ | キキョウ科 | ミゾカクシ属 | Lobelia boninensis |
| オオバマサキ | ニシキギ科 | ニシキギ属 | Euonymus japonicas var. macrophyllus |
| オオハマボウ | アオイ科 | フヨウ属 | Talipariti tiliaceum |
| オオハマボッス | サクラソウ科 | オカトラノオ属 | Lysimachia mauritiana var. rubida |
| オオバミゾホオズキ | ゴマノハグサ科 | ミゾホオズキ属 | Mimulus sessilifolius Maxim. |
| オオバヤシャゼンマイ | ゼンマイ科 | ゼンマイ属 | Osmunda x intermedia |
| オオバヤシャブシ | カバノキ科 | ハンノキ属 | Alnus sieboldiana |
| オオバユキザサ | ユリ科 | ユキザサ属 | Smilacina hondoensis |
| オオハリイ | カヤツリグサ科 | ハリイ属 | Eleocharis congesta |
| オオハリソウ | ムラサキ科 | ヒレハリソウ属 | Symphytum asperum |
| オオハンゲ | サトイモ科 | ハンゲ属 | Pinellia tripartita |
| オオハンゴンソウ | キク科 | オオハンゴンソウ属 | Rudbeckia laciniata |
| オオヒキヨモギ | ゴマノハグサ科 | ヒキヨモギ属 | Siphonostegia laeta |
| オオヒナノウスツボ | ゴマノハグサ科 | ゴマノハグサ属 | Scrophularia kakudensis Franch. |
| オオヒメクグ | カヤツリグサ科 | ヒメクグ属 | Kyllinga nemoralis |
| オオヒョウタンボク | スイカズラ科 | スイカズラ属 | Lonicera tschonoskii Maxim. |
| オオヒヨドリバナ | キク科 | ヒヨドリバナ属 | Eupatorium makinoi var. oppositifolium |
| オオヒラウスユキソウ | キク科 | ウスユキソウ属 | Leontopodium hayachinense var. miyabeanum |
| オオビランジ | ナデシコ科 | マンテマ属 | Silene keiskei |
| オオフガクスズムシ | ラン科 | クモキリソウ属 | Liparis Koreojaponica |
| オオフサモ | アリノトウグサ科 | フサモ属 | Myriophyllum aquaticum |
| オオフジイバラ | バラ科 | バラ属 | Rosa luciae |
| オオブタクサ | キク科 | ブタクサ属 | Ambrosia trifida |
| オオフタバムグラ | アカネ科 | オオフタバムグラ属 | Diodia teres |
| オオベニウツギ | タニウツギ科 | タニウツギ属 | Weigela florida |
| オオベニガシワ | トウダイグサ科 | オオバベニガシワ属 | Alchornea davidii |
| オオベニシダ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris hondoensis Koidz. |
| オオヘビイチゴ | バラ科 | キジムシロ属 | Potentilla recta |
| オオベンケイソウ | ベンケイソウ科 | ムラサキベンケイソウ属 | Hylotelephium spectabile |
| オオホシダ | ヒメシダ科 | ヒメシダ属 | Thelypteris boninensis |
| オオホソバシケシダ | メシダ科 | シケシダ属 | Deparia conilii × japonica |
| オオマツバウンラン | オオバコ科 | マツバウンラン属 | Nuttallanthus texanus |
| オオマツユキソウ | ユリ科 | マツユキソウ属 | Galanthus elwesii Hook. fil. |
| オオマツヨイグサ | アカバナ科 | マツヨイグサ属 | Oenothera erythrosepala |
| オオマムシグサ | サトイモ科 | テンナンショウ属 | Arisaema serratum subsp. amplissmum |
| オオマルバノテンニンソウ | シソ科 | テンニンソウ属 | Leucosceptrum stellipilum var. tosaense |
| オオマルバノホロシ | ナス科 | ナス属 | Solanum megacarpum Koidz |
| オオミサンザシ | バラ科 | サンザシ属 | Crataegus pinnatifida |
| オオミズゴケ | ミズゴケ科 | ミズゴケ属 | Sphagnum palustre |
| オオミスミソウ | キンポウゲ科 | ミスミソウ属 | Hepatica nobilis var.japonica |
| オオミゾソバ | タデ科 | タデ属 | Persicaria thunbergii var. hastatotriloba |
| オオミトベラ | トベラ科 | トベラ属 | Pittosporum chichijimense |
| オオミネイワヘゴ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris lunanensis |
| オオミヤマガマズミ | スイカズラ科 | ガマズミ属 | Viburnum wrightii var. stipellatum |
| オオムラサキシキブ | クマツヅラ科 | ムラサキシキブ属 | Callicarpa japonica var. luxurians |
| オオムラサキツユクサ | ツユクサ科 | ムラサキツユクサ属 | Tradescantia virginiana |
| オオモクゲンジ | ムクロジ科 | モクゲンジ属 | Koelreuteria integrifoliola |
| オオモクセイ | モクセイ科 | モクセイ属 | Osmanthus rigidus |
| オオモミジ | カエデ科 | カエデ属 | Acer palmatum var. amoenum |
| オオモミジガサ | キク科 | オオモミジガサ属 | Miricacalia makineana |
| オオヤマオダマキ | キンポウゲ科 | オダマキ属 | Aquilegia buergeriana var. oxysepala |
| オオヤマサギソウ | ラン科 | ツレサギソウ属 | Platanthera sachalinensis |
| オオヤマザクラ | バラ科 | サクラ属 | Cerasus sargentii |
| オオヤマツツジ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron transiens Nakai |
| オオヤマハコベ | ナデシコ科 | ハコベ属 | Stellaria monosperma var. japonica |
| オオヤマフスマ | ナデシコ科 | オオヤマフスマ属 | Moehringia lateriflora |
| オオユウガギク | キク科 | シオン属 | Aster yomena var. angustifolius |
| オオユリワサビ | アブラナ科 | ワサビ属 | Eutrema okinosimense |
| オオヨモギ | キク科 | ヨモギ属 | Artemisia montana |
| オオリキュウバイ | バラ科 | バイカシモツケ属 | Exochorda x macrantha |
| オオルリソウ | ムラサキ科 | オオルリソウ属 | Cynoglossum furcatum |
| オオレイジンソウ | キンポウゲ科 | トリカブト属 | Aconitum gigas var. hondoense |
| オガサワラアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium boninense |
| オガサワラクチナシ | アカネ科 | クチナシ属 | Gardenia boninensis |
| オガサワラグミ | グミ科 | グミ属 | Elaeagnus rotundata |
| オガサワラシコウラン | ラン科 | マメヅタラン属 | Bulbophyllum boninense |
| オガサワラツルキジノオ | ツルキジノオ科 | ツルキジノオ属 | Lomariopsis boninensis |
| オガサワラビロウ | ヤシ科 | ビロウ属 | Livistona chinensis |
| オガサワラモクマオ | イラクサ科 | カラムシ属 | Boehmeria boninesis |
| オガサワラモクレイシ | マチン科 | オガサワラモクレイシ属 | Geniostoma glabrum |
| オガサワラリュウビンタイ | リュウビンタイ科 | リュウビンタイ属 | Angiopteris boninensis |
| オカスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola phalacrocarpa Maxim. f. glaberrima |
| オカゼリ | セリ科 | ハマゼリ属 | Cnidium monnieri |
| オカダイコン | キク科 | ヌマダイコン属 | Adenostemma latifolium |
| オカタツナミソウ | シソ科 | タツナミソウ属 | Scutellaria brachyspica |
| オガタマノキ | モクレン科 | モクレン属 | Magnolia compressa |
| オカトラノオ | サクラソウ科 | オカトラノオ属 | Lysimachia clethroides |
| オカヒジキ | ヒユ科 | オカヒジキ属 | Salsola komarovii |
| オカメザサ | イネ科 | オカメザサ属 | Shibataea kumasaca Makino |
| オガラバナ | カエデ科 | カエデ属 | Acer ukurunduense |
| オカルガヤ | イネ科 | オカルガヤ属 | Cymbopogon tartilis var. goeringii |
| オギ | イネ科 | ススキ属 | Miscanthus sacchariflorus |
| オキジムシロ | バラ科 | キジムシロ属 | Potentilla supina. |
| オキナアサガオ | ヒルガオ科 | フサヒルガオ属 | Jacquemontia tamnifolia |
| オキナグサ | キンポウゲ科 | オキナグサ属 | Pulsatilla cernua |
| オキナワウラジロガシ | ブナ科 | コナラ属 | Quercus miyagii |
| オキナワウラボシ | ウラボシ科 | オキナワウラボシ属 | Phymatosorus scolopendria |
| オキナワギク | キク科 | シオン属 | Aster miyagii |
| オキナワジュズスゲ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Carex ischnostachya var. fastigiata |
| オキナワスズメウリ | ウリ科 | オキナワスズメウリ属 | Diplocyclos palmatus |
| オキナワスナゴショウ | コショウ科 | サダソウ属 | Peperomia okinawensis |
| オキナワスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola utchinensis |
| オキナワソケイ | モクセイ科 | ソケイ属 | Jasminum superfluum |
| オキナワテイショウソウ | キク科 | モミジハグマ属 | Ainsliaea macroclinidioides Hayata var. okinawensis |
| オキナワハイネズ | ヒノキ科 | ビャクシン属 | Juniperus taxifolia var. lutchuensis |
| オキナワハグマ | キク科 | モミジハグマ属 | Ainsliaea macroclinidioides var. okinawensis |
| オキナワヒメウツギ | ユキノシタ科 | ウツギ属 | Deutzia naseana var. amanoi |
| オキナワヒメナキリ | カヤツリグサ科 | ナキリスゲ属 | Carex sacrosancta var. tamakii |
| オキナワマツバボタン | スベリヒユ科 | スベリヒユ属 | Portulaca okinawensis |
| オキナワヤブムラサキ | クマツヅラ科 | ムラサキシキブ属 | Callicarpa oshimensis var. okinawensis |
| オキノアブラギク | キク科 | キク属 | Dendranthema okiense (Kitam.) Kitam. |
| オククルマムグラ | アカネ科 | ヤエムグラ属 | Galium trifloriforme |
| オクタマスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola×savatieri |
| オクチョウジザクラ | バラ科 | サクラ属 | Prunus apetata ssp. pilosa |
| オクトリカブト | キンポウゲ科 | トリカブト属 | Aconitum japonicum ssp. Subcuneatum |
| オクノカンスゲ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Carex foliosissima |
| オクノミズギク | キク科 | オグルマ属 | Inula ciliaris var. pubescens |
| オクマワラビ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris uniformis |
| オクモミジハグマ | キク科 | モミジハグマ属 | Ainsliaea acerifolia var. subapoda |
| オグラセンノウ | ナデシコ科 | センノウ属 | Lychnis kiusiana |
| オグルマ | キク科 | オグルマ属 | Inula britannica var. chinensis Inula |
| オケラ | キク科 | オケラ属 | Atractylodes japonica |
| オサカスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola tokubuchiana × V. yezoensis |
| オサバグサ | ケシ科 | オサバグサ属 | Pteridophyllum racemosum Sieb |
| オシダ | オシダ科 | オシダ属 | Dryopteris crassirhizoma |
| オシロイバナ | オシロイバナ科 | オシロイバナ属 | Mirabilis jalapa |
| オゼコウホネ | スイレン科 | コウホネ属 | Nuphar pumilum var. ozeense |
| オゼソウ | サクライソウ科 | オゼソウ属 | Japonolirion osense |
| オゼヌマアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium inundatum subsp. Homolepis |
| オゼヌマタイゲキ | トウダイグサ科 | トウダイグサ属 | Euphorbia togakusensis var. ozense |
| オゼノサワトンボ | ラン科 | ミズトンボ属 | Habenaria linearifolia var. brachycentra |
| オゼミズギク | キク科 | オグルマ属 | Imula ciliaris var. glandulosa |
| オタカラコウ | キク科 | メタカラコウ属 | Ligularia fischeri |
| オタクミツツジ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron indicum f. otakumi |
| オッタチカタバミ | カタバミ科 | カタバミ属 | Oxalis dillenii |
| オッタチカンギク | キク科 | キク属 | Dendranthema indicum var. maruyamanum |
| オトギリソウ | オトギリソウ科 | オトリギリソウ属 | Hypericum erectum |
| オトコエシ | オミナエシ科 | オミナエシ属 | Patrinia villosa |
| オトコヨウゾメ | スイカズラ科 | ガマズミ属 | Viburnum phlebotrichum |
| オトコヨモギ | キク科 | ヨモギ属 | Artemisia japanica |
| オトメアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum savatieri |
| オトメスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola grypoceras f. purprellocalcarata |
| オトメフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geraniumu dissectum |
| オドリコカグマ | コバノイシカグマ科 | フモトシダ属 | Microlepia izu-peninsulae |
| オドリコソウ | シソ科 | オドリコソウ属 | Lamium barbatum |
| オナモミ | キク科 | オナモミ属 | Xanthium strumarium |
| オニアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium vulgare |
| オニイタヤ | カエデ科 | カエデ属 | Acer mono var. ambiguum |
| オニイノデ | オシダ科 | イノデ属 | Polystichum rigens |
| オニウシノケグサ | イネ科 | ウシノケグサ属 | Festuca arundinacea |
| オニカナワラビ | オシダ科 | カナワラビ属 | Arachniodes simplicior var.major |
| オニカラスムギ | イネ科 | カラスムギ属 | Avena sterilis |
| オニキランソウ | シソ科 | キランソウ属 | Ajuga dictyocarpa |
| オニグルミ | クルミ科 | クルミ属 | Juglans mandshurica var. sieboldiana |
| オニコバノガマズミ | スイカズラ科 | ガマズミ属 | Viburnum ×kiusiana Hatus. |
| オニシオガマ | ゴマノハグサ科 | シオガマギク属 | Pedicularis nipponica |
| オニシバ | イネ科 | シバ属 | Zoysia macrostachya |
| オニシバリ | ジンチョウゲ科 | ジンチョウゲ属 | Daphne pseudo-mezereum |
| オニシモツケ | バラ科 | シモツケソウ属 | Filipendula kamtschatica |
| オニスゲ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Carex dickinsii |
| オニゼンマイ | ゼンマイ科 | ゼンマイ属 | Osmunda claytoniana |
| オニタビラコ | キク科 | オニタビラコ属 | Youngia japonica |
| オニトウゲシバ | ヒカゲノカズラ科 | ヒカゲノカズラ属 | Huperzia serrata var. longipetiolata |
| オニドコロ | ヤマノイモ科 | ヤマノイモ属 | Dioscorea tokoro |
| オニナルコスゲ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Carex vesicaria |
| オニノゲシ | キク科 | ノゲシ属 | Sonchus asper |
| オニノヤガラ | ラン科 | オニノヤガラ属 | Gastrodia elata |
| オニバス | スイレン科 | オニバス属 | Euryale ferox |
| オニヒカゲワラビ | イワデンダ科 | ノコギリシダ属 | Diplazium nipponicum |
| オニビシ | ヒシ科 | ヒシ属 | Trapa natans var. japonica |
| オニヒョウタンボク | スイカズラ科 | スイカズラ属 | Lonicera vidalii |
| オニヤブソテツ | オシダ科 | ヤブソテツ属 | Cyrtomium falcatum |
| オニヤブマオ | イラクサ科 | カラムシ属 | Boehmeria holosericea |
| オニユリ | ユリ科 | ユリ属 | Lilium lancifolium |
| オニルリソウ | ムラサキ科 | オオルリソウ属 | Cynoglossum asperrimum Nakai |
| オノエマンテマ | ナデシコ科 | カスミソウ属 | Gypsophila cerastioides |
| オノエラン | ラン科 | カモメラン属 | Galearis fauriei |
| オヒシバ | イネ科 | オヒシバ属 | Eleusine indica |
| オヒルギ | ヒルギ科 | オヒルギ属 | Bruguiera gymnorrhiza |
| オヒルムシロ | ヒルムシロ科 | ヒルムシロ属 | Potamogeton natans |
| オヘビイチゴ | バラ科 | キジムシロ属 | Potentilla kleiniana |
| オミナエシ | オミナエシ科 | オミナエシ属 | Patrinia scabiosaefolia |
| オモゴウテンナンショウ | サトイモ科 | テンナンショウ属 | Arisaema iyoanum |
| オモダカ | オモダカ科 | オモダカ属 | Sagittaria trifolia |
| オモト | ユリ科 | オモト属 | Rohdea Japonica |
| オモロカンアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum dissitum |
| オヤブジラミ | セリ科 | ヤブジラミ属 | Torilis scabra |
| オヤマソバ | タデ科 | オンタデ属 | Aconogonon nakaii |
| オヤマボクチ | キク科 | ヤマボクチ属 | Synurus pungens |
| オヤマリンドウ | リンドウ科 | リンドウ属 | Gentiana makinoi |
| オヤリハグマ | キク科 | コウヤボウキ属 | Pertya trilobata |
| オランダガラシ | アブラナ科 | オランダガラシ属 | Nasturtium officinale |
| オランダフウロ | フウロソウ科 | オランダフウロ属 | Erodium cicutarium |
| オランダミミナグサ | ナデシコ科 | ミミナグサ属 | Cerastium glomeratum |
| オリヅルシダ | オシダ科 | イノデ属 | Polystichum lepidocaulon |
| オリヅルスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola stoloniflora |
| オンタデ | タデ科 | オンタデ属 | Pleuropteropyrum weyrichii var. alpinum |
| オンツツジ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron weyrichii |
| カイガンマサキ | ニシキギ科 | ニシキギ属 | Euonymus japonicus var. litoralis |
| カイコバイモ | ユリ科 | バイモ属 | Fritillaria kaiensis |
| カイジンドウ | シソ科 | キランソウ属 | Ajuga ciliata var. villosior |
| カイナンサラサドウダン | ツツジ科 | ドウダンツツジ属 | Enkianthus sikokianus |
| カイノキ | ウルシ科 | カイノキ属 | Pistacia chinensis |
| カイフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium shikokianum var. kai-montanum |
| カエデドコロ | ヤマノイモ科 | ヤマノイモ属 | Dioscorea quinqueloba |
| ガガイモ | ガガイモ科 | ガガイモ属 | Metaplexis japonica |
| カガシラ | カヤツリグサ科 | シンジュガヤ属 | Scleria caricina |
| ガガブタ | ミツガシワ科 | アサザ属 | Nymphoides indica |
| カガミグサ | ブドウ科 | ノブドウ属 | Ampelopsis japonica |
| カカヤンバラ | バラ科 | バラ属 | Rosa bracteata |
| カギカズラ | アカネ科 | カギカズラ属 | Uncaria rhynchophylla |
| カギガタアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum curvistigma |
| カギガタカンアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum curvistigma |
| カキツバタ | アヤメ科 | アヤメ属 | Iris laevigata |
| カキドオシ | シソ科 | カキドオシ属 | Glechoma hederacea var. grandis |
| カキネガラシ | アブラナ科 | カキネガラシ属 | Sisymbrium officinale Scopoli |