| 種名 | 科名 | 属名 | 学名 |
| アイイロニワゼキショウ | アヤメ科 | ニワゼキショウ属 | Sisyrinchium graninoides |
| アイズシモツケ | バラ科 | シモツケ属 | Spiraea chamaedryfolia var. pilosa |
| アイズヒメアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium aidzuense |
| アイナエ | マチン科 | アイナエ属 | Mitrasacme pygmaea var. nipponicum |
| アイノコセンダングサ | キク科 | センダングサ属 | Bidens pilosa L. var. intermedia |
| アオイスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola hondoensis |
| アオイボクロ | ラン科 | ムカゴサイシン属 | Nervilia aragoana |
| アオカズラ | アワブキ科 | アオカズラ属 | Sabia japonica |
| アオカラムシ | イラクサ科 | ヤブマオ属 | Boehmeria nivea var. concolor |
| アオキ | ミズキ科 | アオキ属 | Aucuba japonica |
| アオジガバチソウ | ラン科 | クモキリソウ属 | Listera japonica f. viridis |
| アオチカラシバ | イネ科 | チカラシバ属 | Pennisetum alopeculoides (L.) Spreng. f. viridescens |
| アオチドリ | ラン科 | アオチドリ属 | Coeloglossum viride var. bracteatum |
| アオツヅラフジ | ツヅラフジ科 | アオツヅラフジ属 | Cocculus trilobus |
| アオテンマ | ラン科 | オニノヤガラ属 | Gastrodia elata f. viridis |
| アオナシ | バラ科 | ナシ属 | Ｐyrus ussuriensis var. hondoensis |
| アオネカズラ | ウラボシ科 | エゾデンダ属 | Polypodium niponicum |
| アオハダ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex macropoda |
| アオヒメタデ | タデ科 | タデ属 | Persicaria erectominor f. viridiflora |
| アオフタバラン | ラン科 | フタバラン属 | Listera makinoana Ohwi |
| アオマムシグサ | サトイモ科 | テンナンショウ属 | Arisaema serratum |
| アオミズ | イラクサ科 | ミズ属 | Pilea pumila |
| アオヤギソウ | ユリ科 | シュロソウ属 | Veratrum maackii var. parviflorum |
| アカカタバミ | カタバミ科 | カタバミ属 | Oxalis corniculata f. rubrifolia |
| アカコミヤマスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola maximowicziana f. rubescens |
| アカザ | アカザ科 | アカザ属 | Chenopodium album var. centrorubrum |
| アカシデ | カバノキ科 | クマシデ属 | Carpinus laxiflora |
| アカショウマ | ユキノシタ科 | チダケサシ属 | Astilbe thunbergii |
| アカネ | アカネ科 | アカネ属 | Rubia argyi |
| アカネスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola phalacrocarpa Maxim |
| アカバナ | アカバナ科 | アカバナ属 | Epilobium pyrricholophum |
| アカバナオケラ | キク科 | オケラ属 | Atractylodes ovata |
| アカバナゲンノショウコ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium thunbergii |
| アカバナサツマノギク | キク科 | キク属 | Chrysanthemum ornatum |
| アカバナシモツケソウ | バラ科 | シモツケソウ属 | Filipendula multijuga var. ciliata |
| アカバナツユクサ | ツユクサ科 | ツユクサ属 | Tinantla fugax Scheidw. var. erecta |
| アカバナヒメイワカガミ | イワウメ科 | イワカガミ属 | Schizocodon ilicifolius f. purpureiflorus |
| アカバナミツマタ | ジンチョウゲ科 | ミツマタ属 | Edgeworthia chrysantha Rubra |
| アカバナルリハコベ | サクラソウ科 | ルリハコベ属 | Anagallis arvensis L. f.arvensis |
| アカハナワラビ | ハナヤスリ科 | ハナワラビ属 | Botrychium nipponicum |
| アカフタチツボスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola grypoceras f. variegata |
| アカフナガバノタチツボスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola ovato-oblonga |
| アカフユノハナワラビ | ハナヤスリ科 | ハナワラビ属 | Botrychium nipponicum var. pseudoternatum |
| アカボシタツナミソウ | シソ科 | タツナミソウ属 | Scutellaria rubropunctata Hayata |
| アカミノイヌツゲ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex sugerokii var. brevipedunculata |
| アカメガシワ | トウダイグサ科 | アカメガシワ属 | Mallotus japonicus |
| アカモノ | ツツジ科 | シラタマノキ属 | Gaultheria ovatifolia ssp. Adenothrix |
| アカヤシオ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron pentaphyllum var. nikoense |
| アキカラマツ | キンポウゲ科 | カラマツソウ属 | Thalictrum minus var. hypoleucum |
| アキギリ | シソ科 | アキギリ属 | Salvia glabrescens |
| アキグミ | グミ科 | グミ属 | Elaeagnus umbellata thunb |
| アキザキヤツシロラン | ラン科 | オニノヤガラ属 | Gastrodia confusa Honda et Tuyama |
| アギスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola verecunda |
| アキタブキ | キク科 | フキ属 | Petasites japonicus subsp. giganteus |
| アキチョウジ | シソ科 | ヤマハッカ属 | Plectranthus longitubs |
| アギナシ | オモダカ科 | オモダカ属 | Sagittaria aginashi |
| アキノウナギツカミ | タデ科 | イヌタデ属 | Persicaria sieboldi |
| アキノキリンソウ | キク科 | アキノキリンソウ属 | Solidago virgaurea var. asiatica |
| アキノギンリョウソウ | イチヤクソウ科 | シャクジョウソウ属 | Monotropa uniflora L. |
| アキノタムラソウ | シソ科 | アキギリ属 | Salvia japonica |
| アキノノゲシ | キク科 | アキノノゲシ属 | Lactuca indica |
| アキノミチヤナギ | タデ科 | ミチヤナギ属 | Polygonum polyneuron |
| アクシバ | ツツジ科 | スノキ属 | Vaccinium japonicum |
| アケビ | アケビ科 | アケビ属 | Akebia quinata |
| アケボノアセビ | ツツジ科 | アセビ属 | Pieris japonica f. rosea |
| アケボノオオフジイバラ | バラ科 | バラ属 | Rosa onoei Makino var. oligantha |
| アケボノシュスラン | ラン科 | シュスラン属 | Goodyera foliosa var. laevis |
| アケボノスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola rossii Hemsl. |
| アケボノソウ | リンドウ科 | センブリ属 | Swertia bimaculata |
| アケボノミヤマシキミ | ミカン科 | ミヤマシキミ属 | Skimmia japonica |
| アサギリソウ | キク科 | ヨモギ属 | Artemisia schmidtiana |
| アサザ | ミツガシワ科 | アサザ属 | Nymphoides peltata |
| アサマヒゴタイ | キク科 | トウヒレン属 | Saussurea nipponica subsp . savatiri |
| アサマフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium soboliferum |
| アシズリノジギク | キク科 | キク属 | Chrysanthemum japonense var. ashizuriense |
| アシタカジャコウソウ | シソ科 | ジャコウソウ属 | Chelonopsis yagiharana |
| アスカノイノデ | オシダ科 | イノデ属 | Polystichum fibrillosopaleaceum |
| アズキナシ | バラ科 | ナナカマド属 | Sorbus alnifolia |
| アズマイチゲ | キンポウゲ科 | イチリンソウ属 | Anemone raddeana |
| アズマカモメヅル | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Vincetoxicum sublanceolatum var. albiflorum |
| アズマガヤ | イネ科 | アズマガヤ属 | Hystrix longe-aristata |
| アズマギク | キク科 | ムカシヨモギ属 | Erigeron thunbergii |
| アズマシャクナゲ | ツツジ科 | ツツジ属 | Rhododendron degronianum |
| アズマシロカネソウ | キンポウゲ科 | シロカネソウ属 | Dichocarpum nipponicum |
| アズマナルコ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Ｃａｒｅｘ ｓｈｉｍｉｄｚｅｎｓｉｓ |
| アズマヤマアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium microspicatum Nakai |
| アズマレイジンソウ | キンポウゲ科 | トリカブト属 | Aconitum pterocaule |
| アゼオトギリ | オトギリソウ科 | オトギリソウ属 | Hypericum oliganthum |
| アゼガヤツリ | カヤツリグサ科 | カヤツリグサ属 | Cyperus flavidus |
| アゼスゲ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Carex thunbergii |
| アゼトウナ | キク科 | アゼトウナ属 | Crepidiastrum keiskeanum |
| アゼナ | アゼナ科 | アゼナ属 | Lindernia procumbens |
| アゼナルコ | カヤツリグサ科 | スゲ属 | Carex dimorpholepis |
| アセビ | ツツジ科 | アセビ属 | Pieris japonica |
| アソタカラコウ | キク科 | メタカラコウ属 | Ligularia fischeri var. takeyukii |
| アタシカカナワラビ | コバノイシカグマ科 | カナワラビ属 | Arachniodes oohorae H. Ito |
| アツバタツナミソウ | シソ科 | タツナミソウ属 | Scutellaria tsusimensis |
| アツモリソウ | ラン科 | アツモリソウ属 | Cypripedium macranthum var. speciosum |
| アテツマンサク | マンサク科 | マンサク属 | Hamamelis japonica var. glauca |
| アブクマトラノオ | タデ科 | イブキトラノオ属 | Bistorta abukumensis |
| アブラガヤ | カヤツリグサ科 | ホタルイ属 | Scirpus wichurae |
| アブラススキ | イネ科 | アブラススキ属 | Eccoilopus cotulifer |
| アブラチャン | クスノキ科 | シロモジ属 | Parabenzoin praecox |
| アブラツツジ | ツツジ科 | ドウダンツツジ属 | Enkianthus subsessilis |
| アポイマンテマ | ナデシコ科 | マンテマ属 | Silene repens var. apoiensis |
| アマギアマチャ | ユキノシタ科 | アジサイ属 | Hydrangea macrophylla var. amagiana |
| アマギカンアオイ | ウマノスズクサ科 | カンアオイ属 | Asarum muramatsui |
| アマギベニウツギ | スイカズラ科 | タニウツギ属 | Weigela decora var. amagiensis |
| アマチャヅル | ウリ科 | アマチャヅル属 | Gynostemma pentaphyllum |
| アマドコロ | ユリ科 | アマドコロ属 | Polygonatum odoratum var. pluriflorum |
| アマナ | ユリ科 | アマナ属 | Amana edulis (Miq.) Honda |
| アマニュウ | セリ科 | シシウド属 | Angelica edulis |
| アマミカタバミ | カタバミ科 | カタバミ属 | Oxalis amamiana |
| アマミクサアジサイ | ユキノシタ科 | アジサイ属 | Cardiandra amamiohsimensis |
| アマミタムラソウ | シソ科 | アキギリ属 | Salvia pygmaea var. simplicior |
| アマミナツトウダイ | トウダイグサ科 | トウダイグサ属 | Euphorbia aieboldiana var. amamiana |
| アメリカアゼナ | アゼナ科 | アゼナ属 | Lindernia dubia subsp. Major |
| アメリカイヌホオズキ | ナス科 | ナス属 | Solanum americanum |
| アメリカスミレサイシン | スミレ科 | スミレ属 | Viola sororia |
| アメリカセンダングサ | キク科 | センダングサ属 | Bidens frondosa Linn. |
| アメリカタカサブロウ | キク科 | タカサブロウ属 | Eclipta alba Hasskarl |
| アメリカネナシカズラ | ヒルガオ科 | ネナシカズラ属 | Cuscuta pentagona Engelm. |
| アメリカヒイラギ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex opaca |
| アメリカフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium carolinianum |
| アメリカホドイモ | マメ科 | ホドイモ属 | Apios americana |
| アメリカマンサク | マンサク科 | マンサク属 | Hamamelis virginiana |
| アヤメ | アヤメ科 | アヤメ属 | Iris sanguinea |
| アラゲナツハゼ | ツツジ科 | スノキ属 | Vaccinium ciliatum Thunb. |
| アラゲハンゴンソウ | キク科 | オオハンゴンソウ属 | Rudbeckia hirta var. pulcherrima |
| アラゲヒョウタンボク | スイカズラ科 | スイカズラ属 | Lonicera strophiophora |
| アラゲムラサキ | ムラサキ科 | アラゲムラサキ属 | Amsinckia barbata |
| アラシグサ | ユキノシタ科 | アラシグサ属 | Boykinia lycoctonifolia |
| アリアケスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola betonicifolia var. albescens |
| アリタソウ | ヒユ科 | アカザ属 | Dysphania ambrosioides |
| アリドオシ | アカネ科 | アリドオシ属 | Damnacanthus indicus |
| アリドオシラン | ラン科 | アリドオシラン属 | Myrmechis japonica |
| アリノトウグサ | アリノトウグサ科 | アリノトウグサ属 | Haloragis micrantha |
| アリマウマノスズクサ | ウマノスズクサ科 | ウマノスズクサ属 | Aristolochia onoei |
| アレチウリ | ウリ科 | アレチウリ属 | Sicyos angulatus |
| アレチギシギシ | タデ科 | ギシギシ属 | Rumex conglomeratus |
| アレチヌスビトハギ | マメ科 | ヌスビトハギ属 | Desmodium paniculatum |
| アレチハナガサ | クマツヅラ科 | クマツヅラ属 | Verbena brasiliensis |
| アレチマツヨイグサ | アカバナ科 | マツヨイグサ属 | Oenothera biennis |
| アワガタケスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola awagatakensis |
| アワコガネギク | キク科 | キク属 | Chrysanthemum boreale |
| アワブキ | アワブキ科 | アワブキ属 | Meliosma myrianth |
| アワモリショウマ | ユキノシタ科 | チダケサシ属 | Astilbe japonica |
| アンドンマユミ | ニシキギ科 | ニシキギ属 | Euonymus oligospermus |
| イイギリ | イイギリ科 | イイギリ属 | Idesia polycarpa |
| イガアザミ | キク科 | アザミ属 | Cirsium nipponicum var. comosum |
| イガオナモミ | キク科 | オナモミ属 | Xanthium italicum |
| イガホオズキ | ナス科 | イガホオズキ属 | Physaliastrum japonicum (Fr. et Sav.) Honda. |
| イカリソウ | メギ科 | イカリソウ属 | Epimedium grandiflorum var. thunbergianum |
| イグサ | イグサ科 | イグサ属 | Juncus effusus var. decipiens |
| イケマ | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Cynanchum caudatum |
| イシガキスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola tashiroi var. tairae |
| イシミカワ | タデ科 | イヌタデ属 | Persicaria perfoliata |
| イズカモメヅル | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Vincetoxicum izuense |
| イズノシマダイモンジソウ | ユキノシタ科 | ユキノシタ属 | Saxifraga fortunei var. crassifolia |
| イズハハコ | キク科 | イズハハコ属 | Conyza japonica |
| イスミスズカケ | ゴマノハグサ科 | クガイソウ属 | Veronicastrum nogutii |
| イソギク | キク科 | キク属 | Dendranthema pacificum |
| イソスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola grayi Franch. et Savat. |
| イソツツジ | ツツジ科 | イソツツジ属 | Ledum palustre var. diversipilosum |
| イソマツ | イソマツ科 | イソマツ属 | Limonium wrightii |
| イタチササゲ | マメ科 | レンリソウ属 | Lathyrus davidii |
| イタチハギ | マメ科 | イタチハギ属 | Amorpha fruticosa Linn |
| イタドリ | ゴマノハグサ科 | イタドリ属 | Reynoutria japonica |
| イタヤカエデ | ムクロジ科 | カエデ属 | Acer mono var. marmoratum f. dissectum |
| イタリーマンテマ | ナデシコ科 | マンテマ属 | Silene giraldii Guss |
| イチゴノキ | ツツジ科 | イチゴノキ属 | Arbutus uned |
| イチハツ | アヤメ科 | アヤメ属 | Iris tectorum |
| イチビ | アオイ科 | イチビ属 | Abutilon theophrasti Medic |
| イチヤクソウ | イチヤクソウ科 | イチヤクソウ属 | Pyrola japnica |
| イチヨウラン | ラン科 | イチヨウラン属 | Dactylostalix ringens |
| イチリンソウ | キンポウゲ科 | イチリンソウ属 | Anemone nikoensis |
| イトイヌノヒゲ | ホシクサ科 | ホシクサ属 | Eriocaulon dscemfloum Maxim. |
| イトキンポウゲ | キンポウゲ科 | キンポウゲ属 | Ranunculus reptans |
| イトシャジン | キキョウ科 | ホタルブクロ属 | Campanula rotundifolia |
| イトハコベ | ナデシコ科 | ハコベ属 | Stellaria filicaulis |
| イトヒメハギ | ヒメハギ科 | ヒメハギ属 | Polygala tenuifolia |
| イトラッキョウ | ユリ科 | ネギ属 | Allium virgunculae |
| イナモリソウ | アカネ科 | イナモリソウ属 | Pseudopyxis depressa Miq. |
| イヌウメモドキ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex serrata Thunb. |
| イヌカキネガラシ | アブラナ科 | カキネガラシ属 | Sisymbrium orientalis |
| イヌカタヒバ | イワヒバ科 | イワヒバ属 | Selaginella moellendorffii |
| イヌガラシ | アブラナ科 | イヌガラシ属 | Rorippa indica |
| イヌキクイモ | キク科 | キクイモ属 | Helianthus strumosus |
| イヌコウジュ | シソ科 | イヌコウジュ属 | Mosla punctulata |
| イヌコハコベ | ナデシコ科 | ハコベ属 | Stellaria pallida |
| イヌゴマ | シソ科 | イヌゴマ属 | Stachys japonica var. intermedia |
| イヌコリヤナギ | ヤナギ科 | ヤナギ属 | Salix integra Thunb. |
| イヌザクラ | バラ科 | サクラ属 | Prunus buergeriana |
| イヌザンショウ | ミカン科 | イヌザンショウ属 | Fagara mantchurica |
| イヌシデ | カバノキ科 | クマシデ属 | Carpinus tschonoskii |
| イヌショウマ | キンポウゲ科 | サラシナショウマ属 | Cimicifuga japonica |
| イヌセンブリ | リンドウ科 | センブリ属 | Swertia diluta var. tosaensis |
| イヌタデ | タデ科 | イヌタデ属 | Persicaria longiseta |
| イヌタヌキモ | タヌキモ科 | タヌキモ属 | Utricularia australis |
| イヌツゲ | モチノキ科 | モチノキ属 | Ilex crenata Thunb. |
| イヌトウバナ | シソ科 | トウバナ属 | Clinopodium micranthum |
| イヌナズナ | アブラナ科 | イヌナズナ属 | Draba nemorosa |
| イヌヌマトラノオ | サクラソウ科 | オカトラノオ属 | Lysimachia pilophora |
| イヌノフグリ | ゴマノハグサ科 | クワガタソウ属 | Veronica didyma var. lilac |
| イヌハギ | マメ科 | ハギ属 | Lespedeza tomentosa |
| イヌヒメコズチ | シソ科 | イヌコウジュ属 | Salvia reflexa Hornem |
| イヌビユ | ヒユ科 | ヒユ属 | Amaranthus lividus L. |
| イヌビワ | クワ科 | イチジク属 | Ficus erecta |
| イヌブナ | ブナ科 | ブナ属 | Fagus japonica |
| イヌホオズキ | ナス科 | ナス属 | Solanum nigrum |
| イヌホタルイ | カヤツリグサ科 | ホソガタホタルイ属 | Schoenoplectus juncoides |
| イヌマキ | マキ科 | マキ属 | Podocarpus macrophyllus |
| イヌムラサキ | ムラサキ科 | イヌムラサキ属 | Lithospermum arvense |
| イヌヤマモモソウ | アカバナ科 | ガウラ属 | Gaura parviflora |
| イヌヨモギ | キク科 | ヨモギ属 | Artemisia keiskeana |
| イノデ | オシダ科 | イノデ属 | Polystichum polyblepharum |
| イノモトソウ | イノモトソウ科 | イノモトソウ属 | Pteris multifida |
| イブキシモツケ | バラ科 | シモツケ属 | Japanese Spirea |
| イブキジャコウソウ | シソ科 | イブキジャコウソウ属 | Thymus serpyllum ssp. quinquecostatus |
| イブキスミレ | スミレ科 | スミレ属 | Viola mirabilis var. subglabra |
| イブキゼリモドキ | セリ科 | シラネニンジン属 | Tilingia holopetala |
| イブキトラノオ | タデ科 | イブキトラノオ属 | Polygonum bistorta |
| イブキボウフウ | セリ科 | イブキボウフウ属 | Libanotis coreana |
| イボクサ | ツユクサ科 | イボクサ属 | Murdannia keisak |
| イボタノキ | モクセイ科 | イボタノキ属 | Ligustrum obtusifolium |
| イボタヒョウタンボク | スイカズラ科 | スイカズラ属 | Lonicera demissa Rehder var. demissa |
| イモカタバミ | カタバミ科 | カタバミ属 | Oxalis articulata |
| イモネノホシアサガオ | ヒルガオ科 | サツマイモ属 | Ipomoea trichocarpa |
| イヨカズラ | ガガイモ科 | カモメヅル属 | Vincetoxicum japonicum C.Morren et Decne. |
| イヨフウロ | フウロソウ科 | フウロソウ属 | Geranium shikokianum |
| イラクサ | イラクサ科 | イラクサ属 | Urtica thunbergiana |
| イロハモミジ | カエデ科 | カエデ属. | Acer palmatum |
| イワアカバナ | アカバナ科 | アカバナ属 | Epilobium cephalostigma |
| イワイチョウ | ミツガシワ科 | イワイチョウ属 | Nephrophyllidium crista-galli |
| イワインチン | キク科 | キク属 | Chrysanthemum rupestre |
| イワウチワ | イワウメ科 | イワウチワ属 | Shortia uniflora |
| イワオウギ | マメ科 | イワオウギ属 | Hedysarum vicioides subsp. japonicum var. japonicum |
| イワオトギリ | オトギリソウ科 | オトギリソウ属 | Hypericum erectum var. hondoense |
| イワカガミ | イワウメ科 | イワカガミ属 | Schizocodon soldanelloides |
| イワガネゼンマイ | ホウライシダ科 | イワガネゼンマイ属 | Coniogramme intermedia |
| イワガネソウ | ホウライシダ科 | イワガネゼンマイ属 | Coniogramme japonica |
| イワカラクサ | ゴマノハグサ科 | エリヌス属 | Erinus alpinus |
| イワガラミ | ユキノシタ科 | イワガラミ属 | Schizophragma hydrangeoides |
| イワギク | キク科 | キク属 | Dendranthema zawadskii |
| イワギボウシ | ユリ科 | ギボウシ属 | Ｈosta longipes |
| イワギリソウ | イワタバコ科 | イワギリソウ属 | Opithandra primuloides |
| イワキンバイ | バラ科 | キジムシロ属 | Potentilla dickinsii |
| イワザクラ | サクラソウ科 | サクラソウ属 | Primula tosaensis Yatabe |
| イワシモツケ | バラ科 | シモツケ属 | Spiraea nipponica |
| イワシャジン | キキョウ科 | ツリガネニンジン属 | Adenophora takedae |
